Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Dock7-202ENSMUST00000075836 6704 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Afm-202ENSMUST00000128740 2465 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Tsacc-201ENSMUST00000010682 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm24195-201ENSMUST00000116804 137 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm8084-201ENSMUST00000120807 752 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm11258-201ENSMUST00000121086 1218 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm25178-201ENSMUST00000122633 325 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Tsc22d1-205ENSMUST00000133224 786 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 4930551L18Rik-201ENSMUST00000156086 700 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Apol11a-201ENSMUST00000172191 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm4246-201ENSMUST00000172822 216 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Pid1-203ENSMUST00000175996 892 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 1700015G11Rik-201ENSMUST00000180038 397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm5251-201ENSMUST00000188959 472 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm38078-201ENSMUST00000192771 392 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm5541-201ENSMUST00000193248 1113 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm37555-201ENSMUST00000195711 542 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Mir1897-202ENSMUST00000198006 79 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm9710-201ENSMUST00000198053 499 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm44285-201ENSMUST00000203557 940 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Olfr737-ps1-201ENSMUST00000205382 283 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Il15-203ENSMUST00000209573 1164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm35454-202ENSMUST00000214817 1101 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm4804-203ENSMUST00000222542 577 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Spink6-201ENSMUST00000068473 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm38077-201ENSMUST00000193657 3245 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Vmn2r118-201ENSMUST00000168440 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Ddr2-205ENSMUST00000194690 8590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 AC152922.2-201ENSMUST00000213353 3879 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Pecam1-204ENSMUST00000106796 3441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Galnt5-203ENSMUST00000166729 3812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Olfr539-202ENSMUST00000218865 11486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Adgrl3-207ENSMUST00000118078 4871 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Nr6a1-210ENSMUST00000168098 5877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Igkv8-28-201ENSMUST00000103380 305 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Rgs8-204ENSMUST00000111814 678 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm15224-201ENSMUST00000120501 388 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm16157-202ENSMUST00000135564 1082 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Klra8-201ENSMUST00000014476 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm13068-202ENSMUST00000146250 876 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm15389-201ENSMUST00000153774 666 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Fbxl12-210ENSMUST00000155301 476 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm23740-201ENSMUST00000157385 100 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm25692-201ENSMUST00000175444 125 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm21304-201ENSMUST00000180568 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm21293-202ENSMUST00000180664 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm4340-202ENSMUST00000181036 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm21312-203ENSMUST00000181239 1185 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Rpl28P41105 Gm4340-203ENSMUST00000181615 1258 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.6 ms