Protein–RNA interactions for Protein: P40201

Chd1, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 1, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chd1P40201 Gm4510-201ENSMUST00000218265 427 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AC163684.1-201ENSMUST00000223766 927 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Olfr11-201ENSMUST00000043081 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Snora44-201ENSMUST00000082670 129 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AC158622.2-201ENSMUST00000217363 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Adsl-201ENSMUST00000023043 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Rasgrf2-201ENSMUST00000099326 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm42047-202ENSMUST00000212899 4988 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AC139750.1-201ENSMUST00000223962 1300 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Zfp141-203ENSMUST00000174407 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Synj2-206ENSMUST00000115787 4013 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Chd7-202ENSMUST00000051558 10216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Prokr2-202ENSMUST00000110156 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Tpm3-rs2-201ENSMUST00000116350 323 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm11504-201ENSMUST00000120211 173 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AC124426.2-201ENSMUST00000220886 404 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Olfr1378-201ENSMUST00000052285 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Olfr516-201ENSMUST00000071410 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Calcoco2-202ENSMUST00000097162 968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Mtor-202ENSMUST00000103221 8564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Imp4-201ENSMUST00000027303 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm44996-201ENSMUST00000208787 2980 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Olfr90-205ENSMUST00000216488 3188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Col28a1-201ENSMUST00000115537 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Olfr1512-202ENSMUST00000214980 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Olfr523-204ENSMUST00000214272 3780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 4933427D14Rik-202ENSMUST00000108506 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Vmn2r16-201ENSMUST00000165180 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm42669-202ENSMUST00000160160 3080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gfm2-209ENSMUST00000161825 4416 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Il12a-202ENSMUST00000107816 1268 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 4930412L05Rik-202ENSMUST00000146501 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Slamf7-205ENSMUST00000194791 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 AC164881.1-201ENSMUST00000215648 664 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Zwint-202ENSMUST00000105431 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Inpp5d-209ENSMUST00000168783 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Pbdc1-201ENSMUST00000033577 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Gm44090-201ENSMUST00000204669 1834 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Platr8-201ENSMUST00000146110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Chd1P40201 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm26422-201ENSMUST00000104276 132 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Smim8-203ENSMUST00000108132 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Sox5os2-201ENSMUST00000156443 627 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Hivep2-201ENSMUST00000015645 9763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 4930448H16Rik-201ENSMUST00000159838 580 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm20491-201ENSMUST00000173765 1241 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm27355-201ENSMUST00000185045 128 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm5418-201ENSMUST00000206932 528 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 AC132833.4-201ENSMUST00000228313 203 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Prl2c3-201ENSMUST00000099805 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Fyco1-202ENSMUST00000167595 7692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm15721-201ENSMUST00000138406 3308 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Pot1b-201ENSMUST00000086876 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Slc12a3-201ENSMUST00000034218 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 C730027H18Rik-202ENSMUST00000219822 3268 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Rgs8-203ENSMUST00000111812 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Armcx3-201ENSMUST00000081834 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Abcg8-201ENSMUST00000045714 3667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Ankrd27-201ENSMUST00000040844 4284 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm7212-201ENSMUST00000120817 348 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm27010-201ENSMUST00000182727 863 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm27167-201ENSMUST00000183752 511 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm20770-201ENSMUST00000193474 694 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm42814-201ENSMUST00000199370 460 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Lrrc29-204ENSMUST00000210801 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Gm46401-201ENSMUST00000221291 1089 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 1700109H08Rik-201ENSMUST00000008451 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 1700034E13Rik-201ENSMUST00000091904 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Olfr1012-201ENSMUST00000099916 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Chd1P40201 Rab3gap2-201ENSMUST00000069652 7052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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