Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Mxi1-203ENSMUST00000111737 4843 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Mbd4-202ENSMUST00000122816 2415 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Aass-201ENSMUST00000031707 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Birc2-202ENSMUST00000074246 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr54-203ENSMUST00000217480 5048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ppih-204ENSMUST00000106319 622 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm11585-201ENSMUST00000120901 569 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm22311-201ENSMUST00000158006 110 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Esd-208ENSMUST00000177137 853 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Esd-209ENSMUST00000177181 835 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm26641-201ENSMUST00000181499 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Trav6d-4-202ENSMUST00000183820 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm29008-201ENSMUST00000189387 298 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 2010103J01Rik-201ENSMUST00000192375 388 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ighv8-15-201ENSMUST00000197770 294 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm43346-201ENSMUST00000198290 685 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm2505-201ENSMUST00000200413 825 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm36816-201ENSMUST00000204824 493 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr706-201ENSMUST00000209025 1087 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm40418-201ENSMUST00000218806 1013 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm19073-201ENSMUST00000219978 555 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 3830406C13Rik-203ENSMUST00000223631 1014 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Tex37-201ENSMUST00000063456 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AI429214-201ENSMUST00000098825 1930 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Pi4ka-201ENSMUST00000036161 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Mllt10-202ENSMUST00000114669 3865 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Mapk1ip1l-202ENSMUST00000166743 4542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm45201-201ENSMUST00000207187 2679 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Cast-210ENSMUST00000223126 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gas2l3-201ENSMUST00000099374 6748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr316-202ENSMUST00000215071 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Usp50-201ENSMUST00000028842 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Nalcn-201ENSMUST00000000201 7122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm29194-201ENSMUST00000189250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Il15ra-217ENSMUST00000148748 1542 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Chil4-201ENSMUST00000082219 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Slc41a2-201ENSMUST00000039956 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Krt39-202ENSMUST00000107445 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 4930550L24Rik-202ENSMUST00000118305 1684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Sorbs2-214ENSMUST00000134675 1692 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Sorbs2-222ENSMUST00000141039 1699 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 9530027J09Rik-201ENSMUST00000180584 1684 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Crtam-202ENSMUST00000180384 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 5830416I19Rik-201ENSMUST00000198687 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Smarca2-246ENSMUST00000209085 1841 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Zfp317-201ENSMUST00000079042 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Vmn1r70-203ENSMUST00000226255 4868 ntAPPRIS P2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ctnna2-206ENSMUST00000162273 3277 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Rfwd3-201ENSMUST00000038739 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ampd3-208ENSMUST00000213373 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm9125-201ENSMUST00000178458 2233 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm45786-201ENSMUST00000213021 2278 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm10743-201ENSMUST00000219611 2358 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Aldh1l2-201ENSMUST00000020497 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Clec2g-201ENSMUST00000000254 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Tardbp-205ENSMUST00000105700 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm12931-201ENSMUST00000117046 324 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm8916-201ENSMUST00000119732 949 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm14155-201ENSMUST00000127230 587 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm26652-201ENSMUST00000180592 373 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Mir8094-201ENSMUST00000183361 117 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm18875-201ENSMUST00000188563 882 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 1700034P13Rik-204ENSMUST00000189431 555 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ighv1-21-201ENSMUST00000194856 351 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 D13Ertd608e-202ENSMUST00000195797 704 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm44590-201ENSMUST00000206161 391 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm39383-201ENSMUST00000216894 1009 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms