Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm16123-201ENSMUST00000118647 1517 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 9430098F02Rik-201ENSMUST00000180832 2986 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Olfr998-202ENSMUST00000215083 1399 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 CT025600.1-202ENSMUST00000220264 2510 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Adam5-202ENSMUST00000118419 2791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Cdc42bpa-204ENSMUST00000111117 9161 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Cdkal1-201ENSMUST00000006353 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
P10404 Gm37067-201ENSMUST00000195730 1628 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm12378-201ENSMUST00000116171 1461 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm18359-201ENSMUST00000173024 1459 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm45537-201ENSMUST00000211539 2708 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Olfr53-201ENSMUST00000084456 1328 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm1982-201ENSMUST00000188615 1887 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Kcnma1-224ENSMUST00000224077 3537 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 U2surp-201ENSMUST00000078374 3520 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm14144-201ENSMUST00000128602 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Trip4-210ENSMUST00000179395 7055 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Tars2-203ENSMUST00000098857 3228 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Cyp2c44-202ENSMUST00000211830 1557 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 BC055308-201ENSMUST00000193380 2538 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Nol4-202ENSMUST00000081423 3309 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Met-201ENSMUST00000080469 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Mtbp-205ENSMUST00000170046 3197 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Brd8-202ENSMUST00000097626 3005 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Ighv1-67-201ENSMUST00000103538 294 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm25762-201ENSMUST00000103984 132 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 0610037L13Rik-204ENSMUST00000106727 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Mrps23-202ENSMUST00000107915 332 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm13771-201ENSMUST00000117988 238 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Olfr1103-ps1-201ENSMUST00000119132 937 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm14945-201ENSMUST00000119556 1118 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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P10404 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm13362-201ENSMUST00000137186 839 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm23897-201ENSMUST00000158110 158 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Malat1-202ENSMUST00000173314 556 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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P10404 Gm16596-201ENSMUST00000180576 604 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 4831440E17Rik-201ENSMUST00000181942 1028 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 1700030O20Rik-201ENSMUST00000185546 594 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 1700006F04Rik-201ENSMUST00000188582 441 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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P10404 Gm43647-201ENSMUST00000198142 486 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm42429-201ENSMUST00000198579 558 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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P10404 4930540M03Rik-201ENSMUST00000216952 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 4930401C15Rik-201ENSMUST00000218300 865 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm9118-201ENSMUST00000219246 754 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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P10404 AC124196.1-201ENSMUST00000225970 1032 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 AC114585.2-203ENSMUST00000228400 339 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Llcfc1-201ENSMUST00000031900 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Slurp2-201ENSMUST00000057932 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Fabp3-ps1-201ENSMUST00000070435 402 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm5619-201ENSMUST00000071172 760 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Fxyd7-201ENSMUST00000073892 693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Zfp825-201ENSMUST00000074369 822 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Fcgr4-201ENSMUST00000078825 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm25586-201ENSMUST00000082499 112 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Gm20110-201ENSMUST00000218263 2095 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Adamts3-202ENSMUST00000163159 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Adamts3-201ENSMUST00000061427 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Araf-202ENSMUST00000120356 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 AC122357.2-201ENSMUST00000220732 1525 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Asb17-201ENSMUST00000044089 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
P10404 Olfr353-202ENSMUST00000215925 1615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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