Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Bnip1-206ENSMUST00000135824 629 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm14242-201ENSMUST00000145204 375 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm25265-201ENSMUST00000158520 347 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm4340-201ENSMUST00000163113 807 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Ankrd55-204ENSMUST00000168684 1005 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm25190-201ENSMUST00000176664 95 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Mir6999-201ENSMUST00000183498 61 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm27218-201ENSMUST00000183745 392 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm31243-202ENSMUST00000198354 628 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 C030029H02Rik-202ENSMUST00000210356 2980 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm30400-202ENSMUST00000210562 2115 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm32688-201ENSMUST00000213849 585 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Lipk-201ENSMUST00000054260 2125 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr195-201ENSMUST00000075381 995 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC165080.3-201ENSMUST00000217162 3116 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Cfap74-203ENSMUST00000105619 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr221-201ENSMUST00000052560 2741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Mapk10-205ENSMUST00000128869 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Nr1h5-202ENSMUST00000196135 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 CT010453.1-201ENSMUST00000226795 2201 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Wdr7-201ENSMUST00000072726 7109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Cep85l-201ENSMUST00000095691 2560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Zbtb26-202ENSMUST00000102789 2047 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm29555-201ENSMUST00000188620 1497 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm12800-201ENSMUST00000075999 1455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Ntrk3-202ENSMUST00000039438 3977 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Il5ra-203ENSMUST00000205004 2271 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Hsf2-201ENSMUST00000079833 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Phf7-206ENSMUST00000228437 1373 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Ccdc163-203ENSMUST00000106463 1159 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm15913-201ENSMUST00000118492 331 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm13552-201ENSMUST00000118837 417 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm4918-201ENSMUST00000119420 1084 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm8577-201ENSMUST00000122420 986 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm22915-201ENSMUST00000157615 136 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 9130230L23Rik-201ENSMUST00000165250 492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 1700039M10Rik-201ENSMUST00000180397 532 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Rps19-ps5-201ENSMUST00000180745 403 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Rps19-ps6-201ENSMUST00000181233 438 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Klk1b7-ps-202ENSMUST00000183762 619 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 9330159M07Rik-204ENSMUST00000188156 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm29066-201ENSMUST00000188502 452 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm38143-201ENSMUST00000191751 644 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr316-201ENSMUST00000203731 1011 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm45155-201ENSMUST00000207365 596 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm35501-202ENSMUST00000215101 459 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC166256.1-201ENSMUST00000219081 1271 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 CT009711.4-201ENSMUST00000225685 198 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC116487.1-201ENSMUST00000227033 339 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC154738.3-201ENSMUST00000227953 409 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC134414.1-201ENSMUST00000228499 1221 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Asb12-201ENSMUST00000033549 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm26130-201ENSMUST00000083171 138 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm21541-201ENSMUST00000098128 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr1055-201ENSMUST00000099894 1182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr1278-203ENSMUST00000213727 6744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm13416-201ENSMUST00000117264 1612 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Usp17la-201ENSMUST00000067695 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm9268-201ENSMUST00000166914 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r62-201ENSMUST00000169130 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm26786-201ENSMUST00000180410 6243 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Lgi1-204ENSMUST00000196090 1789 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm36823-203ENSMUST00000199408 1792 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm18310-201ENSMUST00000206494 3912 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr3-202ENSMUST00000213988 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm32486-201ENSMUST00000209810 3816 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC154406.1-201ENSMUST00000215220 2529 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 D930007P13Rik-201ENSMUST00000181306 1324 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Lrrc46-201ENSMUST00000021251 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 AC124581.3-201ENSMUST00000224270 1624 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Zfp938-201ENSMUST00000041264 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm42874-201ENSMUST00000198888 1774 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms