Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 C130093G08Rik-201ENSMUST00000202489 2226 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr725-202ENSMUST00000206920 1519 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Panct2-201ENSMUST00000181489 3849 ntTSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm44581-201ENSMUST00000206227 1693 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Mnat1-201ENSMUST00000021523 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Uba1y-202ENSMUST00000190013 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm20560-201ENSMUST00000204577 3513 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm40309-201ENSMUST00000202699 1752 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm36011-201ENSMUST00000208671 2719 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Ivd-201ENSMUST00000028807 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Cs-201ENSMUST00000005826 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Pbrm1-205ENSMUST00000112092 5009 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 9630028H03Rik-201ENSMUST00000129868 2364 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Fbxo3-203ENSMUST00000111135 3740 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Lypd8-202ENSMUST00000108826 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Parp11-204ENSMUST00000112195 733 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Usp17le-ps-201ENSMUST00000117954 957 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm14906-201ENSMUST00000119265 390 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm15828-201ENSMUST00000119911 522 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Crem-209ENSMUST00000129435 1160 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm12064-201ENSMUST00000133819 533 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 E130215H24Rik-201ENSMUST00000145525 939 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm12301-201ENSMUST00000152963 523 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 1700034H15Rik-205ENSMUST00000154116 926 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm17059-201ENSMUST00000168284 519 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm20319-201ENSMUST00000172522 771 ntTSL 2 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm6695-201ENSMUST00000177264 1172 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Vis1-201ENSMUST00000183957 201 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm37185-201ENSMUST00000193852 410 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm43568-202ENSMUST00000198427 476 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 5430402P08Rik-201ENSMUST00000211799 1143 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Ldah-206ENSMUST00000218086 1159 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm2649-201ENSMUST00000218825 610 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm5173-201ENSMUST00000219616 950 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm8153-201ENSMUST00000219844 952 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC137871.3-201ENSMUST00000226628 225 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Ubd-201ENSMUST00000038844 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r73-201ENSMUST00000055070 912 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm1988-201ENSMUST00000188190 2565 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Prom1-201ENSMUST00000030973 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC154903.1-201ENSMUST00000222121 2705 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 9530052C20Rik-201ENSMUST00000181882 1372 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Cyfip1-202ENSMUST00000085255 4195 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Efl1-206ENSMUST00000207868 1537 ntTSL 3 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 4930519E07Rik-201ENSMUST00000200907 1665 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Prdm10-205ENSMUST00000215847 3519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Cep170-201ENSMUST00000057037 6930 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Exoc3-201ENSMUST00000035934 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm42648-201ENSMUST00000200774 2505 ntBASIC8.17□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Lin54-204ENSMUST00000137750 4056 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Acsl4-202ENSMUST00000112903 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Acsl4-203ENSMUST00000112904 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Prame-202ENSMUST00000113159 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm7206-201ENSMUST00000117730 508 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Mrpl1-202ENSMUST00000117766 3556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm11220-201ENSMUST00000118844 475 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm16072-201ENSMUST00000119574 2377 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm12312-201ENSMUST00000120351 644 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm12313-201ENSMUST00000121347 421 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Cyb5a-205ENSMUST00000163083 676 ntTSL 3 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Asb14-203ENSMUST00000165929 1817 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Prol1-201ENSMUST00000170832 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps148-201ENSMUST00000176775 455 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm8324-201ENSMUST00000178911 1204 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Smim18-201ENSMUST00000179364 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm9903-201ENSMUST00000181102 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Mir6415-201ENSMUST00000184064 100 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Mir8097-201ENSMUST00000185150 119 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm28126-201ENSMUST00000185286 356 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm28212-201ENSMUST00000187114 356 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm29568-201ENSMUST00000187884 356 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm29080-201ENSMUST00000188565 356 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm28944-201ENSMUST00000188946 356 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm28908-201ENSMUST00000189002 356 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm29078-201ENSMUST00000190611 356 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm7115-201ENSMUST00000193706 832 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
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