Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Cd209b-201ENSMUST00000084086 2039 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Olfr1364-203ENSMUST00000213912 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.49□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Etv1-210ENSMUST00000161980 1939 ntTSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Ank3-240ENSMUST00000183169 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Hdac9-204ENSMUST00000209750 3204 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Pja2-204ENSMUST00000172818 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Ccdc191-206ENSMUST00000178400 3643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Cyp2c29-202ENSMUST00000176624 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm8662-201ENSMUST00000118644 574 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm14319-201ENSMUST00000142937 703 ntTSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Slc29a1-208ENSMUST00000164769 1226 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm24923-201ENSMUST00000178201 88 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 1700040L08Rik-201ENSMUST00000205011 541 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 AV026068-229ENSMUST00000225516 595 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Olfr1494-201ENSMUST00000051768 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Olfr220-201ENSMUST00000085861 978 ntAPPRIS P1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Clasp1-202ENSMUST00000070989 7767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Filip1l-203ENSMUST00000159816 4452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Olfr605-202ENSMUST00000215417 2921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Zfp239-201ENSMUST00000079405 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Utrn-201ENSMUST00000076817 12382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm26575-201ENSMUST00000181714 2232 ntBASIC8.48□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Pfkfb2-204ENSMUST00000171479 3342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm6866-201ENSMUST00000188559 2549 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Etl4-202ENSMUST00000066509 7197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Serpinb1b-201ENSMUST00000016951 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm43123-201ENSMUST00000201893 3471 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
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Ccdc47Q9D024 Ceacam1-203ENSMUST00000098669 2873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm24647-201ENSMUST00000157112 113 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm22119-201ENSMUST00000175594 99 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps36-201ENSMUST00000177206 723 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps16-201ENSMUST00000177624 1137 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps17-201ENSMUST00000178341 1137 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Obox4-ps18-201ENSMUST00000179441 1137 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm8305-201ENSMUST00000180022 1195 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm44692-201ENSMUST00000207441 901 ntTSL 3 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 AC160338.3-201ENSMUST00000214836 384 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm22504-201ENSMUST00000082963 139 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Gm43606-201ENSMUST00000195938 3556 ntBASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Anapc10-203ENSMUST00000210812 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Lrrtm3-201ENSMUST00000105439 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.47□□□□□ -1.05
Ccdc47Q9D024 Hsdl2-202ENSMUST00000107528 2626 ntTSL 2 BASIC8.47□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms