Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ71

Rpa3, Replication protein A 14 kDa subunit, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpa3Q9CQ71 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm18830-201ENSMUST00000199036 1396 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Mroh4-201ENSMUST00000023271 3583 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Cyp2c66-201ENSMUST00000087234 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Olfr525-202ENSMUST00000214594 5137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Evi5-201ENSMUST00000112642 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Apobec3-203ENSMUST00000165537 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Ppp3cc-203ENSMUST00000228911 1836 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Trps1-204ENSMUST00000183757 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Trappc1-202ENSMUST00000102601 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 A330102I10Rik-203ENSMUST00000145801 737 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm20690-202ENSMUST00000195126 355 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm45319-201ENSMUST00000210220 318 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 AC133948.2-201ENSMUST00000217850 378 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 AC139941.1-201ENSMUST00000221517 478 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 AC140267.1-201ENSMUST00000226485 213 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r204-201ENSMUST00000091728 909 ntAPPRIS P1 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm1604a-201ENSMUST00000097422 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Nudt5-201ENSMUST00000026927 4764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm36041-201ENSMUST00000218971 2245 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Wdr63-201ENSMUST00000160285 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm37163-201ENSMUST00000195439 1690 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Ctage5-208ENSMUST00000175877 2612 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Dock9-208ENSMUST00000212376 8107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Il1f9-201ENSMUST00000057567 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Cdhr3-201ENSMUST00000095774 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm5286-201ENSMUST00000159524 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm6011-201ENSMUST00000211736 1796 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Pde10a-206ENSMUST00000115720 3328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Igkv2-137-201ENSMUST00000103302 501 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm17170-201ENSMUST00000112785 316 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm12601-201ENSMUST00000118994 846 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm12331-201ENSMUST00000119927 622 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm12459-201ENSMUST00000120659 356 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm37662-201ENSMUST00000195649 667 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm42938-201ENSMUST00000198414 1072 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 4930568A13Rik-201ENSMUST00000199961 1061 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm43108-201ENSMUST00000200525 293 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm44380-201ENSMUST00000203125 293 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm44931-201ENSMUST00000206056 545 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Lnp1-201ENSMUST00000210579 671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gnb1-ps3-201ENSMUST00000212191 950 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 1700040E09Rik-201ENSMUST00000222440 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 AC134468.2-202ENSMUST00000222820 1120 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 AC165287.1-201ENSMUST00000224985 178 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Ropn1-201ENSMUST00000023530 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Ino80c-201ENSMUST00000055012 909 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Olfr743-201ENSMUST00000071294 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Slc4a4-202ENSMUST00000113218 3269 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Zbtb38-201ENSMUST00000093798 4091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
Rpa3Q9CQ71 Prokr2-201ENSMUST00000049997 4486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms