Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

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Length 1,454 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PtprtQ99M80 Uba7-201ENSMUST00000035216 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Ambn-201ENSMUST00000031226 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Gucy2c-201ENSMUST00000032338 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Lncenc1-202ENSMUST00000179324 2764 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Add1-205ENSMUST00000114340 3761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Srek1ip1-201ENSMUST00000022230 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Sf3b1-201ENSMUST00000027127 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Gin1-203ENSMUST00000112844 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Slc5a6-205ENSMUST00000202520 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Prcp-202ENSMUST00000207594 2245 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Wdpcp-201ENSMUST00000020568 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Synpo2-202ENSMUST00000106426 7063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Olfr1474-203ENSMUST00000220113 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Trim40-201ENSMUST00000087158 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Trpm2-203ENSMUST00000105401 7274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Pcdhga2-201ENSMUST00000193869 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Ucp2-202ENSMUST00000126534 3988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
PtprtQ99M80 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Utp14a-201ENSMUST00000080713 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
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PtprtQ99M80 Gm18586-201ENSMUST00000217265 518 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 Fkbp1a-ps2-201ENSMUST00000219474 311 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 AC164618.3-201ENSMUST00000224863 681 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Rpl37a-201ENSMUST00000059980 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm24621-201ENSMUST00000082679 140 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
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PtprtQ99M80 Mapk9-203ENSMUST00000102778 4447 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Gm37829-201ENSMUST00000193864 2213 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
PtprtQ99M80 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms