Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Cep295-203ENSMUST00000098979 7188 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Abcc1-201ENSMUST00000100167 6792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Dclre1b-204ENSMUST00000106834 3705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm17167-201ENSMUST00000169242 5054 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Epha7-202ENSMUST00000080934 2880 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm10778-202ENSMUST00000189672 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm29654-201ENSMUST00000186886 2169 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm28226-201ENSMUST00000186916 2169 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Arfgef3-202ENSMUST00000215836 14579 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Cstf2t-201ENSMUST00000066039 3750 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm28440-201ENSMUST00000186328 1499 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 4933411O13Rik-201ENSMUST00000050665 1464 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Cfl2-201ENSMUST00000078124 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm17229-202ENSMUST00000166792 1753 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gngt2-202ENSMUST00000100532 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Elavl2-206ENSMUST00000107116 1282 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm13651-201ENSMUST00000119086 1110 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm13466-201ENSMUST00000121515 999 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Defa-ps10-201ENSMUST00000121649 171 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm12828-201ENSMUST00000136115 289 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm13261-201ENSMUST00000137351 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 1700060C16Rik-201ENSMUST00000150559 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm22339-201ENSMUST00000157718 62 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm7281-201ENSMUST00000160010 543 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm22698-201ENSMUST00000175375 108 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Mir1231-201ENSMUST00000175639 81 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Calm5-201ENSMUST00000183198 589 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Ly6c2-204ENSMUST00000191451 538 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Ighv1-38-201ENSMUST00000192755 349 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm38289-201ENSMUST00000194273 597 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Fbxw27-201ENSMUST00000197125 810 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm3604-203ENSMUST00000202194 736 ntTSL 3 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm20559-206ENSMUST00000202696 358 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm44930-201ENSMUST00000207545 489 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 E230032D23Rik-203ENSMUST00000208797 856 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm30504-203ENSMUST00000209762 1048 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm39154-201ENSMUST00000210257 560 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm46103-201ENSMUST00000217614 341 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 AC124397.1-201ENSMUST00000224296 653 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 AC162857.1-201ENSMUST00000226614 400 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 CT009556.2-201ENSMUST00000227980 1123 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Tas2r102-201ENSMUST00000069268 1044 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Uts2b-201ENSMUST00000070531 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Olfr801-201ENSMUST00000072063 957 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Rps12-ps3-201ENSMUST00000086764 494 ntAPPRIS P1 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Dmrtc1c2-202ENSMUST00000087899 717 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 6720489N17Rik-201ENSMUST00000091563 318 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Fgf1-201ENSMUST00000040647 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Nrxn3-210ENSMUST00000167887 3303 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm45056-201ENSMUST00000208140 3462 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm43211-201ENSMUST00000196901 1899 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm29660-201ENSMUST00000185631 2166 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm29309-201ENSMUST00000186251 2166 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm28317-201ENSMUST00000187200 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm28254-201ENSMUST00000189207 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm29063-201ENSMUST00000190236 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm29632-201ENSMUST00000190335 2166 ntTSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm28538-201ENSMUST00000190919 2166 ntTSL 5 BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Wac-202ENSMUST00000092112 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Trpv5-201ENSMUST00000031901 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 AW822252-205ENSMUST00000192662 1352 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 AC061963.2-201ENSMUST00000213541 2739 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Msantd4-201ENSMUST00000047173 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC7.57□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Virma-201ENSMUST00000055372 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gabrb3-202ENSMUST00000085240 5712 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm7972-203ENSMUST00000209180 2184 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Siah3-201ENSMUST00000164848 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Myof-211ENSMUST00000226068 6633 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Tmem144-201ENSMUST00000029568 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Schip1-207ENSMUST00000182997 1557 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Tbc1d5-201ENSMUST00000024717 5435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Olfr1055-203ENSMUST00000213564 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Olfr1128-201ENSMUST00000102624 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Olfr133-201ENSMUST00000113636 1090 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm12604-201ENSMUST00000118382 380 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm11997-201ENSMUST00000118697 313 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm13532-201ENSMUST00000120373 240 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Apela-202ENSMUST00000142822 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm14022-201ENSMUST00000143857 691 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 Gm12371-201ENSMUST00000144029 1091 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Rnf144aQ925F3 9530034E10Rik-201ENSMUST00000146982 502 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms