Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Zbtb18-202ENSMUST00000094276 4204 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Plcb1-201ENSMUST00000070724 3853 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Cep57l1-209ENSMUST00000189770 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Zmat3-201ENSMUST00000029199 7797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Itga1-201ENSMUST00000061673 10967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Slc25a53-202ENSMUST00000113069 3189 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Olfr348-202ENSMUST00000213498 3540 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Map2-202ENSMUST00000077355 5125 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Cyp2c39-201ENSMUST00000025968 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm37653-201ENSMUST00000195401 3578 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm11622-201ENSMUST00000120525 691 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm12720-201ENSMUST00000123834 472 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm16093-201ENSMUST00000141455 392 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Polr3g-204ENSMUST00000161920 733 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm9381-201ENSMUST00000182285 1012 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Mir378d-201ENSMUST00000184232 110 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Mir6357-201ENSMUST00000184246 104 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm37425-201ENSMUST00000193184 432 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 5033403H07Rik-202ENSMUST00000198248 756 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm8539-201ENSMUST00000199822 501 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Spin2g-202ENSMUST00000203586 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm44971-201ENSMUST00000206192 337 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm45282-201ENSMUST00000209439 681 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Spata19-204ENSMUST00000214287 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 AC164550.1-201ENSMUST00000217821 1066 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Spata31-202ENSMUST00000221202 814 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Olfr1364-201ENSMUST00000057453 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 n-R5s29-201ENSMUST00000082836 119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm13769-202ENSMUST00000214797 2340 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm43970-201ENSMUST00000204346 3605 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Focad-201ENSMUST00000097992 5791 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Asxl2-201ENSMUST00000092003 11934 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Akt3-203ENSMUST00000111160 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 4930518I15Rik-201ENSMUST00000099141 1331 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Zkscan16-201ENSMUST00000107554 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Apobec4-201ENSMUST00000068875 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Krit1-202ENSMUST00000171023 5582 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm21671-201ENSMUST00000162387 2421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Slc6a18-202ENSMUST00000109679 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm839-201ENSMUST00000079186 1843 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Hepacam2-201ENSMUST00000049985 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Ifit3-201ENSMUST00000102825 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Ncoa4-202ENSMUST00000163336 4065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Ugt3a1-201ENSMUST00000022861 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Mei1-204ENSMUST00000189540 3718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 1110008L16Rik-201ENSMUST00000021411 3122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Oscp1-201ENSMUST00000035497 5013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 F2rl2-201ENSMUST00000022182 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm17184-201ENSMUST00000111864 462 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Rpl36-ps7-201ENSMUST00000119462 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm11257-201ENSMUST00000121313 315 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 4933431E20Rik-206ENSMUST00000138472 483 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Il21-202ENSMUST00000161015 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm7244-201ENSMUST00000164658 455 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm6489-201ENSMUST00000178167 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm7426-201ENSMUST00000179046 404 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Cldn17Q8BXA6 Gm23139-201ENSMUST00000179454 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms