Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Grip1-215ENSMUST00000148954 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Tpd52l2-204ENSMUST00000108800 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Sos2-203ENSMUST00000182396 3963 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Ubl7-209ENSMUST00000216925 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 1700074P13Rik-202ENSMUST00000122181 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 AC154368.2-201ENSMUST00000222334 1724 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Kcnk10-202ENSMUST00000221240 7460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Acsm5-201ENSMUST00000066465 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Tmc2-202ENSMUST00000166774 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Crbn-202ENSMUST00000113239 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm16153-201ENSMUST00000132184 4118 ntTSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Lamb3-202ENSMUST00000159955 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm25631-201ENSMUST00000104390 130 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm5135-201ENSMUST00000121100 573 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 4933430M04Rik-201ENSMUST00000152726 744 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm28041-201ENSMUST00000166080 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm18848-201ENSMUST00000182069 792 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 1700109I08Rik-201ENSMUST00000185680 396 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Usp48Q3V0C5 Gm28864-201ENSMUST00000189251 644 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 1700031M16Rik-204ENSMUST00000189724 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Usp48Q3V0C5 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm30735-201ENSMUST00000199488 726 ntTSL 3 BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Usp48Q3V0C5 AC158981.3-201ENSMUST00000226844 1024 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Mapk9-202ENSMUST00000043321 1297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Krtap3-1-201ENSMUST00000055502 604 ntAPPRIS P1 BASIC9.56□□□□□ -0.88
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Usp48Q3V0C5 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm25189-201ENSMUST00000083911 164 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Pik3cg-205ENSMUST00000217915 3340 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 AC154171.3-201ENSMUST00000224519 2505 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Chid1-207ENSMUST00000153191 4182 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Siae-202ENSMUST00000213126 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Vegfd-201ENSMUST00000033751 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Hnrnpa3-203ENSMUST00000111962 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Pfkfb2-211ENSMUST00000189534 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Pclaf-201ENSMUST00000045802 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Ganc-205ENSMUST00000135074 4780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Usp48Q3V0C5 Gm9117-202ENSMUST00000193529 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Usp48Q3V0C5 Gk-202ENSMUST00000113978 4279 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Usp48Q3V0C5 Deptor-201ENSMUST00000023056 3300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Usp48Q3V0C5 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Usp48Q3V0C5 Gcnt2-201ENSMUST00000067778 4038 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
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Usp48Q3V0C5 Gm43849-201ENSMUST00000201086 215 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Olfr1357-203ENSMUST00000205085 1012 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm4800-201ENSMUST00000215776 1266 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 AC151982.1-201ENSMUST00000223546 464 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Clec2d-201ENSMUST00000032260 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Cldn34b3-201ENSMUST00000096389 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Olfr633-201ENSMUST00000098188 939 ntAPPRIS P1 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm46430-207ENSMUST00000222254 1703 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Arpp21-202ENSMUST00000070218 3181 ntTSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Mr1-201ENSMUST00000027744 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Cpvl-203ENSMUST00000204674 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm7534-201ENSMUST00000097849 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 CT571245.1-201ENSMUST00000218642 3465 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm8212-201ENSMUST00000166350 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Epb41l5-203ENSMUST00000163147 3370 ntTSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm17821-201ENSMUST00000223448 1693 ntBASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gtf3c2-210ENSMUST00000202639 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Adam18-201ENSMUST00000033957 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.55□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Ciao1-201ENSMUST00000003759 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Tbc1d24-206ENSMUST00000168410 7683 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
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