Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Grem2-201ENSMUST00000055294 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc170-202ENSMUST00000138112 3350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt2b-203ENSMUST00000113252 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12021-201ENSMUST00000121061 1746 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1418-202ENSMUST00000214796 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Impg2-202ENSMUST00000069936 6890 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pcyt1b-202ENSMUST00000113933 4867 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29617-206ENSMUST00000187759 1600 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28749-205ENSMUST00000187886 1600 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29000-208ENSMUST00000190932 1600 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pcyt1b-201ENSMUST00000045898 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10693-201ENSMUST00000144146 2037 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1241-202ENSMUST00000214743 2328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm23529-201ENSMUST00000104562 132 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AI480526-201ENSMUST00000159072 957 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37724-201ENSMUST00000195240 1221 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40538-201ENSMUST00000220610 578 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC154461.4-201ENSMUST00000224878 468 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Elovl6-201ENSMUST00000071402 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm34777-201ENSMUST00000219688 2505 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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Ccndbp1Q3TVC7 Trim75-201ENSMUST00000095295 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap6-203ENSMUST00000112127 3973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 D5Ertd577e-202ENSMUST00000202481 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 4933424M12Rik-201ENSMUST00000132609 1944 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC154747.4-203ENSMUST00000225893 1384 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Lix1-201ENSMUST00000115576 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ccndbp1Q3TVC7 Zfp397-201ENSMUST00000060762 5472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ccndbp1Q3TVC7 Ccdc83-202ENSMUST00000107220 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ccndbp1Q3TVC7 Prkag2os1-201ENSMUST00000134633 991 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ccndbp1Q3TVC7 2610035D17Rik-204ENSMUST00000150712 947 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7393-201ENSMUST00000172650 739 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17973-201ENSMUST00000174509 520 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5272-201ENSMUST00000182730 982 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28341-201ENSMUST00000190883 472 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29011-201ENSMUST00000191059 712 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37689-201ENSMUST00000193139 275 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 D530018E20Rik-201ENSMUST00000205107 958 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm44982-201ENSMUST00000208795 471 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm45399-201ENSMUST00000209955 1016 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 2610203C20Rik-215ENSMUST00000212373 1574 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Nup93-207ENSMUST00000212824 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC158531.2-201ENSMUST00000224264 473 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Cd74-201ENSMUST00000050487 1218 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tnfaip6-201ENSMUST00000065927 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22865-201ENSMUST00000083949 214 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms