Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Gm29383-201ENSMUST00000188284 480 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm20379-201ENSMUST00000188317 1204 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm7265-201ENSMUST00000192735 3502 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 4930565D16Rik-201ENSMUST00000192777 1112 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm42597-201ENSMUST00000196663 1544 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm34144-201ENSMUST00000197039 259 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Smarca2-238ENSMUST00000208589 1054 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr1440-202ENSMUST00000213657 7588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Scaper-201ENSMUST00000037408 5158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr384-201ENSMUST00000072993 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Ktn1-210ENSMUST00000187839 7945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr1173-202ENSMUST00000216887 5363 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Piwil2-201ENSMUST00000048129 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Chd9-205ENSMUST00000209423 9419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Kcnab1-201ENSMUST00000049230 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Maats1-202ENSMUST00000114740 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ppp1r9a-201ENSMUST00000035813 9547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Pira2-202ENSMUST00000119469 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr675-204ENSMUST00000215899 3737 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ifit1bl2-201ENSMUST00000087357 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Tph1-201ENSMUST00000049298 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 4930415H17Rik-201ENSMUST00000122396 123 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 E130111B04Rik-201ENSMUST00000156781 450 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm23187-201ENSMUST00000175746 86 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm38254-201ENSMUST00000192276 1009 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm34583-203ENSMUST00000202586 454 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm19065-201ENSMUST00000203269 788 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC134859.1-201ENSMUST00000214085 721 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC124742.1-201ENSMUST00000219909 547 ntTSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Serpina3h-201ENSMUST00000049922 1239 ntTSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Slco6b1-201ENSMUST00000167383 2492 ntTSL 2 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 4930516K23Rik-201ENSMUST00000074064 6133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Rtel1-201ENSMUST00000048608 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Dnah11-201ENSMUST00000084806 14072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 A730011C13Rik-202ENSMUST00000141787 1877 ntTSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Vmn1r197-202ENSMUST00000226225 5326 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr859-202ENSMUST00000212540 9532 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Rps15a-204ENSMUST00000131374 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.64□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm37790-201ENSMUST00000193136 3346 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Tpo-201ENSMUST00000021005 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Slc37a3-201ENSMUST00000090243 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm14471-201ENSMUST00000141035 2358 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm37382-201ENSMUST00000193032 1596 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm3139-201ENSMUST00000178330 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm3183-201ENSMUST00000180076 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Olfr517-202ENSMUST00000216500 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 9330182O14Rik-202ENSMUST00000228780 2053 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Obox6-201ENSMUST00000108513 1344 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm37891-201ENSMUST00000195585 1326 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Nt5c1b-205ENSMUST00000217944 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Acod1-201ENSMUST00000022722 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Vmn2r-ps159-202ENSMUST00000096792 2574 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Fam107b-204ENSMUST00000115054 601 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm13444-201ENSMUST00000119445 522 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm15538-201ENSMUST00000121410 313 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm16336-201ENSMUST00000126011 380 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
Trim71Q1PSW8 Gm12414-201ENSMUST00000150794 494 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
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