Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Nrxn3-205ENSMUST00000163134 7922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm15813-201ENSMUST00000142286 2541 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm44104-201ENSMUST00000204736 3777 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm29571-201ENSMUST00000191547 1909 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 F830045P16Rik-201ENSMUST00000050309 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 AC124680.1-201ENSMUST00000223923 1585 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Ctnnd1-219ENSMUST00000111693 6255 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Slc2a2-201ENSMUST00000029240 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Trim66-203ENSMUST00000106741 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Kcnj15-208ENSMUST00000113862 5705 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Lama1-201ENSMUST00000035471 9518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Musk-202ENSMUST00000084578 3347 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm20752-201ENSMUST00000197341 2833 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm14252-201ENSMUST00000131801 3215 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Lage3-202ENSMUST00000114152 746 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm16276-201ENSMUST00000131218 262 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm16152-201ENSMUST00000131663 872 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm11963-201ENSMUST00000149826 500 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm23968-201ENSMUST00000175047 125 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm26654-201ENSMUST00000180455 256 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 1700108F19Rik-208ENSMUST00000191447 660 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm3511-201ENSMUST00000199823 204 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm18469-201ENSMUST00000208850 439 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm45626-201ENSMUST00000210093 361 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 AL671874.1-201ENSMUST00000223746 1123 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Olfr539-201ENSMUST00000078967 960 ntAPPRIS P2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 H2-M9-202ENSMUST00000087167 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Med1-203ENSMUST00000107545 8024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Myom1-202ENSMUST00000073211 5602 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 9030624J02Rik-201ENSMUST00000033280 2934 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Pomk-201ENSMUST00000061850 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r4-202ENSMUST00000175724 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r6-202ENSMUST00000176481 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gdap1-201ENSMUST00000026879 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC10.15□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 D6Wsu163e-201ENSMUST00000032497 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gja10-201ENSMUST00000056517 2117 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Ing5-201ENSMUST00000027505 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Hipk3-203ENSMUST00000111125 3651 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm12101-201ENSMUST00000121590 390 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm12827-201ENSMUST00000132690 660 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Mir1932-201ENSMUST00000157390 90 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 6530403H02Rik-203ENSMUST00000183168 843 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm43091-201ENSMUST00000198157 423 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm18012-201ENSMUST00000204558 773 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 AC164436.1-201ENSMUST00000227074 772 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 AC135086.1-201ENSMUST00000228621 817 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Vmn1r74-201ENSMUST00000050416 915 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Cetn1-201ENSMUST00000062769 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 2010111I01Rik-202ENSMUST00000091560 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Slc38a9-201ENSMUST00000052514 8910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Smurf2-206ENSMUST00000167787 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Umodl1-202ENSMUST00000066981 4662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Tex14-201ENSMUST00000060835 4763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Olfr1378-202ENSMUST00000213259 4324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Tmcc1-203ENSMUST00000172510 2612 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm37465-201ENSMUST00000192845 3290 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Synpo2-207ENSMUST00000198584 9203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Cntn2-201ENSMUST00000086521 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Olfr293-203ENSMUST00000215280 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Sbno1-216ENSMUST00000199808 10161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Tma16-201ENSMUST00000026681 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Cdh16-204ENSMUST00000211903 2874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Olfr666-202ENSMUST00000214757 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Itgae-202ENSMUST00000102537 3825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Ighv12-3-201ENSMUST00000103485 353 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm25785-201ENSMUST00000104129 125 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Crisp4-202ENSMUST00000115340 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Snord88a-201ENSMUST00000116723 90 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm14974-201ENSMUST00000139112 804 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm24176-201ENSMUST00000158928 121 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Nanog-ps2-201ENSMUST00000190988 529 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm37148-201ENSMUST00000195097 716 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm37637-201ENSMUST00000195540 1256 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 4930572K03Rik-201ENSMUST00000196713 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm18430-201ENSMUST00000197534 682 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Gm9869-202ENSMUST00000214999 679 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Atf6-201ENSMUST00000027974 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 1700014D04Rik-201ENSMUST00000055343 795 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Ttc21bQ0HA38 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.9 ms