Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm10913-201ENSMUST00000133732 463 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm14133-201ENSMUST00000139471 1274 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm12081-201ENSMUST00000152849 501 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm25455-201ENSMUST00000157946 325 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm42161-201ENSMUST00000196278 726 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC137678.1-201ENSMUST00000198370 118 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm44786-201ENSMUST00000208165 1008 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr587-ps1-202ENSMUST00000209201 477 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr602-ps1-202ENSMUST00000218213 1169 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC154747.4-202ENSMUST00000223826 852 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm2840-201ENSMUST00000048361 411 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Vmn1r198-201ENSMUST00000091733 903 ntAPPRIS P2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 D6Ertd474e-201ENSMUST00000100817 2149 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Psg17-201ENSMUST00000004655 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Abcc9-201ENSMUST00000073173 7433 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Zeb2-213ENSMUST00000176732 1762 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Colec10-201ENSMUST00000036737 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Golga3-202ENSMUST00000112512 8132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Trim5-201ENSMUST00000051795 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm12789-201ENSMUST00000106914 883 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm15665-201ENSMUST00000119116 847 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm13940-201ENSMUST00000121023 301 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm14787-201ENSMUST00000121236 388 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm11916-201ENSMUST00000132759 650 ntTSL 2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Smim26-201ENSMUST00000136628 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm11482-201ENSMUST00000147067 719 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm13727-201ENSMUST00000154480 424 ntTSL 3 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 1700054K02Rik-201ENSMUST00000181755 376 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC102689.1-201ENSMUST00000220511 1090 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC166822.1-201ENSMUST00000227667 636 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr1383-201ENSMUST00000077143 940 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 4930444G20Rik-201ENSMUST00000092672 1773 ntAPPRIS P1 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm15681-201ENSMUST00000137501 2704 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ttf1-201ENSMUST00000100237 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Daw1-203ENSMUST00000113436 1351 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm36930-201ENSMUST00000195431 2376 ntBASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Lrp1-201ENSMUST00000049149 14888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Adgrf5-206ENSMUST00000226087 4954 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm42577-201ENSMUST00000201367 3211 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm8127-201ENSMUST00000163655 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Dnah17-203ENSMUST00000106308 14973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Prkacb-203ENSMUST00000106137 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Slc17a1-201ENSMUST00000006785 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Prokr2-204ENSMUST00000142766 3932 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Dus4l-201ENSMUST00000020977 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm20768-201ENSMUST00000199527 2338 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Cdk2ap1-203ENSMUST00000111473 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Rps8-ps3-201ENSMUST00000121011 650 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm12642-201ENSMUST00000121098 876 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Wdr83os-202ENSMUST00000140621 630 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm13840-201ENSMUST00000149608 256 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm25437-201ENSMUST00000158282 132 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm27458-201ENSMUST00000185108 121 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Crcp-206ENSMUST00000202756 600 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm38840-201ENSMUST00000204716 843 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Hba-x-201ENSMUST00000020531 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm45370-201ENSMUST00000211274 483 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Uqcrb-201ENSMUST00000021993 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms