Protein–RNA interactions for Protein: P20664

Prim1, DNA primase small subunit, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim1P20664 Gm45756-201ENSMUST00000212491 407 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 RMST_1.1-205ENSMUST00000218060 997 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AC133183.2-201ENSMUST00000221543 280 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Cinp-209ENSMUST00000222457 723 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Ly6f-201ENSMUST00000023247 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr924-201ENSMUST00000072977 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr298-201ENSMUST00000077800 999 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr1331-201ENSMUST00000094831 954 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Eif4b-201ENSMUST00000169681 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Eny2-201ENSMUST00000060652 3000 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Ddx46-203ENSMUST00000223736 5612 ntAPPRIS P2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Col4a5-202ENSMUST00000112931 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr978-202ENSMUST00000217600 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm45292-201ENSMUST00000211232 2207 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Supt7l-201ENSMUST00000065388 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm37262-201ENSMUST00000192816 1818 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm18637-201ENSMUST00000217665 1900 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Ogdhl-201ENSMUST00000022480 3449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Slc11a2-205ENSMUST00000138843 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm13575-201ENSMUST00000142353 1520 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Spen-202ENSMUST00000105786 12299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm37843-201ENSMUST00000195213 2639 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Sgsh-202ENSMUST00000100172 4223 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Egflam-201ENSMUST00000058593 4778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Rimbp2-205ENSMUST00000199537 6966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Fbxo16-203ENSMUST00000224629 3781 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Tmcc1-209ENSMUST00000173548 1622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gbp9-202ENSMUST00000100961 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Rnf165-201ENSMUST00000026494 7300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Cnot2-202ENSMUST00000105265 2268 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Fbxo11-201ENSMUST00000005504 4019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Duxbl2-201ENSMUST00000100810 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm43533-201ENSMUST00000202933 2936 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Ovol1-201ENSMUST00000025861 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm37703-201ENSMUST00000192292 1784 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr1357-201ENSMUST00000095473 1826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Slc7a2-202ENSMUST00000098816 3677 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Vps8-202ENSMUST00000096192 4942 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm43420-201ENSMUST00000198012 1857 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Trav9n-4-201ENSMUST00000103626 595 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Kpna2-202ENSMUST00000106768 541 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Ghrh-202ENSMUST00000109536 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm14712-201ENSMUST00000120195 772 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm25320-201ENSMUST00000122551 324 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm16008-201ENSMUST00000126009 810 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 A630023P12Rik-201ENSMUST00000129007 1221 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm15868-201ENSMUST00000144291 520 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm11444-201ENSMUST00000146433 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm22491-201ENSMUST00000157190 102 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Vmn2r-ps52-201ENSMUST00000176211 612 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm9274-201ENSMUST00000182505 984 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm29000-202ENSMUST00000185562 571 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm9142-201ENSMUST00000187161 955 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm28749-204ENSMUST00000187827 571 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm29178-207ENSMUST00000188496 1013 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm28844-206ENSMUST00000189297 815 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm29439-201ENSMUST00000189996 509 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm7478-201ENSMUST00000201054 581 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm44140-201ENSMUST00000204157 675 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm45016-201ENSMUST00000208375 396 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm9689-201ENSMUST00000210009 428 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr175-ps1-202ENSMUST00000215069 1201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AC160338.2-201ENSMUST00000215508 281 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AC155929.1-201ENSMUST00000220217 1276 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AC163041.2-201ENSMUST00000223082 573 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Apcs-201ENSMUST00000027824 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Prr32-201ENSMUST00000040002 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AA467197-201ENSMUST00000047498 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm8882-201ENSMUST00000080849 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm22362-201ENSMUST00000083102 134 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Dhx30-204ENSMUST00000196171 3885 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm15127-202ENSMUST00000101190 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Nat1-201ENSMUST00000026677 1347 ntAPPRIS P2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 G430049J08Rik-201ENSMUST00000179907 2686 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 CT572985.1-201ENSMUST00000220599 4714 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm28581-201ENSMUST00000186086 2177 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Elovl2-202ENSMUST00000117096 3797 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Nrxn3-201ENSMUST00000057634 4634 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Rtkn2-202ENSMUST00000105437 3932 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Gm18491-201ENSMUST00000192492 1594 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Cyp2e1-202ENSMUST00000209253 1582 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Tmem177-201ENSMUST00000037906 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Adgrl3-213ENSMUST00000120292 5026 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Snapc4-202ENSMUST00000114115 4368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Katnal1-201ENSMUST00000047257 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Tbx19-201ENSMUST00000027859 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Ctnnd1-207ENSMUST00000111676 5852 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Olfr1392-207ENSMUST00000217275 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Dach2-205ENSMUST00000113382 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prim1P20664 L3mbtl2-201ENSMUST00000023029 3487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Tdpoz1-202ENSMUST00000181541 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Zkscan1-204ENSMUST00000110963 4670 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Prim1P20664 Rasgrf2-201ENSMUST00000099326 3567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms