Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Btbd35f9-201ENSMUST00000178219 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Btbd35f22-201ENSMUST00000178747 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Btbd35f30-201ENSMUST00000179069 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Btbd35f25-201ENSMUST00000179086 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Btbd35f29-201ENSMUST00000179532 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Btbd35f8-201ENSMUST00000180004 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Btbd35f26-201ENSMUST00000180197 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm29021-201ENSMUST00000185451 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm29071-201ENSMUST00000185729 1488 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28799-201ENSMUST00000186506 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28663-201ENSMUST00000186567 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28470-201ENSMUST00000186912 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28971-201ENSMUST00000187506 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28733-202ENSMUST00000187597 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28820-201ENSMUST00000188530 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm29606-202ENSMUST00000188564 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm29225-202ENSMUST00000188647 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28152-201ENSMUST00000188694 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28771-202ENSMUST00000189399 1499 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28741-201ENSMUST00000189417 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28540-202ENSMUST00000189573 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm29122-203ENSMUST00000189609 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28613-201ENSMUST00000189627 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28816-202ENSMUST00000189686 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm29584-202ENSMUST00000190181 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28293-202ENSMUST00000190417 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28463-203ENSMUST00000191085 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28124-202ENSMUST00000191099 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm29217-202ENSMUST00000191270 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm28332-203ENSMUST00000191389 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm37346-201ENSMUST00000191665 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm37454-202ENSMUST00000193918 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm38371-202ENSMUST00000193996 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm37434-203ENSMUST00000194239 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm37840-202ENSMUST00000194805 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm37687-203ENSMUST00000195020 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm37071-203ENSMUST00000195814 1498 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Mbd3l2-202ENSMUST00000213777 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 A230028O05Rik-201ENSMUST00000181655 2793 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Atf2-204ENSMUST00000112007 4195 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Lpin2-203ENSMUST00000126681 4167 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Defb20-201ENSMUST00000109836 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Rnf170-203ENSMUST00000110575 966 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm8688-201ENSMUST00000118240 969 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Rps14-203ENSMUST00000122279 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm15187-201ENSMUST00000122329 264 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm15416-201ENSMUST00000131080 442 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Olfr330-201ENSMUST00000134055 1134 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Mir1964-201ENSMUST00000158514 83 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm15628-201ENSMUST00000162051 547 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm5611-201ENSMUST00000164523 852 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Csn3-201ENSMUST00000001667 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Spc25-209ENSMUST00000167875 1194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm20500-201ENSMUST00000174621 321 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm25735-201ENSMUST00000175164 215 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 1110059E24Rik-202ENSMUST00000177577 599 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm27168-201ENSMUST00000183394 361 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm27199-201ENSMUST00000185026 623 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm29197-201ENSMUST00000185922 702 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 1700019D03Rik-205ENSMUST00000190726 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 4930590H14Rik-201ENSMUST00000193999 551 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm10522-201ENSMUST00000194503 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 4633401B06Rik-201ENSMUST00000198169 1073 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm43726-201ENSMUST00000199110 775 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm8168-201ENSMUST00000209631 948 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm45295-201ENSMUST00000210393 1046 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 AC153962.2-201ENSMUST00000219417 550 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 AC147096.1-201ENSMUST00000227648 352 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Fabp5-201ENSMUST00000029046 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Cwc15-201ENSMUST00000004200 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Olfr410-201ENSMUST00000052254 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Olfr600-201ENSMUST00000056222 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Mrps36-ps1-201ENSMUST00000061311 306 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Olfr402-201ENSMUST00000073675 1012 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm6887-201ENSMUST00000080945 482 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Mylk4-201ENSMUST00000057428 5571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 AU020206-202ENSMUST00000206358 3009 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 C330024D21Rik-203ENSMUST00000202828 1714 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 AC130217.2-201ENSMUST00000224009 2990 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Mageb18-202ENSMUST00000113955 2163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Gm4994-201ENSMUST00000118379 2187 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Nfatc3-206ENSMUST00000212742 3207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Smim18J3QNP2 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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