Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 1110002J07Rik-201ENSMUST00000181710 2229 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm5702-201ENSMUST00000185629 2469 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm36527-201ENSMUST00000195500 3029 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Tmem87a-203ENSMUST00000110729 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Npm1-203ENSMUST00000101375 966 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gstm7-203ENSMUST00000106688 783 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Prl8a8-202ENSMUST00000110350 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm12599-201ENSMUST00000120534 792 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm12632-201ENSMUST00000121223 495 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm15530-201ENSMUST00000122206 555 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm11491-201ENSMUST00000129441 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm13175-201ENSMUST00000139479 466 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm15124-201ENSMUST00000142053 953 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm16143-201ENSMUST00000155982 538 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Rpl29-ps1-201ENSMUST00000161849 508 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r1-201ENSMUST00000169123 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm8974-201ENSMUST00000175770 479 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm4891-201ENSMUST00000182279 912 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm27209-201ENSMUST00000183834 898 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm28100-201ENSMUST00000186560 582 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37469-201ENSMUST00000193728 890 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm17965-201ENSMUST00000193904 517 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 1110003F10Rik-201ENSMUST00000199441 767 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm44129-201ENSMUST00000203511 675 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm26797-203ENSMUST00000216452 706 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm18243-201ENSMUST00000220756 887 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm9472-201ENSMUST00000221625 526 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Eps15-201ENSMUST00000030281 2980 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Rhox11-201ENSMUST00000054147 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r35-201ENSMUST00000071414 891 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Olfr890-201ENSMUST00000079804 945 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Rab1a-206ENSMUST00000163483 2657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm26876-201ENSMUST00000180875 2387 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Cyp4a30b-201ENSMUST00000119958 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Meg3-209ENSMUST00000146701 14548 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Exoc2-201ENSMUST00000021785 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Klf5-202ENSMUST00000226784 2852 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r218-205ENSMUST00000227741 9624 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Vmn2r88-201ENSMUST00000022438 2574 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm26648-201ENSMUST00000181925 5831 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Map7d2-201ENSMUST00000043151 3087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Mlip-211ENSMUST00000184415 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r90-208ENSMUST00000227788 7018 ntAPPRIS P2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Scn9a-203ENSMUST00000112354 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Tsga10-208ENSMUST00000193669 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Sptlc3-202ENSMUST00000110083 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37877-201ENSMUST00000191630 2709 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 AI662270-202ENSMUST00000143673 1428 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Aldh1l2-206ENSMUST00000146640 3938 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm42595-201ENSMUST00000196771 1607 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm43181-201ENSMUST00000197001 2072 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Vwa5a-202ENSMUST00000118144 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Asap1-206ENSMUST00000175799 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Wdr19-201ENSMUST00000041892 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Ezh1-203ENSMUST00000107285 4193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Kmt2c-201ENSMUST00000045291 14967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37426-201ENSMUST00000195241 2470 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Slc38a6-202ENSMUST00000101313 1546 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Ncoa6-201ENSMUST00000043126 6872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Mpp5-201ENSMUST00000082024 5470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm14819-201ENSMUST00000101645 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm15186-201ENSMUST00000119345 563 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Cldn34c3J3QJW5 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms