Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Vmn1r12-202ENSMUST00000226866 6639 ntAPPRIS P2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Ptrhd1-201ENSMUST00000179139 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm37706-201ENSMUST00000195379 2765 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm45182-201ENSMUST00000207579 2404 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 CT009480.1-201ENSMUST00000225771 4480 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm10558-201ENSMUST00000147494 1661 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Mapk10-202ENSMUST00000112846 2617 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Olfr122-202ENSMUST00000172582 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm38251-201ENSMUST00000192968 2575 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Fam13a-201ENSMUST00000089860 5786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Igkv1-117-201ENSMUST00000103317 404 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Dtwd1-201ENSMUST00000110437 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm10651-201ENSMUST00000118212 609 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm13224-201ENSMUST00000119586 94 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm9208-201ENSMUST00000120468 948 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm12670-201ENSMUST00000123606 576 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm12144-201ENSMUST00000136288 1292 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Far1os-201ENSMUST00000138253 893 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm15668-201ENSMUST00000140506 678 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm15230-201ENSMUST00000153701 510 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm25277-201ENSMUST00000157266 324 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Paip1-206ENSMUST00000173627 1233 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Nxf1-205ENSMUST00000183939 1017 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Mir6972-201ENSMUST00000184774 64 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm29362-201ENSMUST00000187898 133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm29018-202ENSMUST00000191356 313 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm29250-201ENSMUST00000191372 368 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm6140-201ENSMUST00000192494 966 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 2610034O05Rik-201ENSMUST00000194078 855 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm44392-201ENSMUST00000196758 115 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm45888-201ENSMUST00000212348 1229 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm33103-201ENSMUST00000212717 527 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm19011-201ENSMUST00000221777 808 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 4933409F18Rik-201ENSMUST00000221910 1267 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 AC163041.1-201ENSMUST00000221984 133 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 AC154184.2-201ENSMUST00000225335 349 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Vmn1r41-204ENSMUST00000227039 985 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 AC154484.2-201ENSMUST00000228359 818 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Olfr218-201ENSMUST00000057548 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Olfr1387-201ENSMUST00000073824 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Tardbp-203ENSMUST00000095719 1011 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Olfr665-201ENSMUST00000098165 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Asph-209ENSMUST00000108335 2514 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Gm7978-202ENSMUST00000201129 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 BC061212-201ENSMUST00000094587 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Actr10-201ENSMUST00000021479 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Cwc22-204ENSMUST00000111821 3388 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 1700029M20Rik-203ENSMUST00000153347 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
H2-M5A7VMS3 EU599041-203ENSMUST00000205748 1492 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Plp1-201ENSMUST00000033800 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Nxpe4-202ENSMUST00000215780 2875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm42549-201ENSMUST00000202392 7004 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Olfr1426-202ENSMUST00000208703 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Senp8-207ENSMUST00000217093 1663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Usp7-207ENSMUST00000160405 4745 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm44752-201ENSMUST00000207140 3305 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Spata31d1a-202ENSMUST00000224469 1616 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm5431-202ENSMUST00000109210 2971 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm44897-201ENSMUST00000206187 1341 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Ttc17-201ENSMUST00000055081 3163 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 AC135669.2-201ENSMUST00000215636 4958 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Fto-202ENSMUST00000125471 3887 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Rdx-203ENSMUST00000163153 4131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm6746-201ENSMUST00000108774 483 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Prh1-202ENSMUST00000111972 870 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Defa33-201ENSMUST00000120874 426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm15859-201ENSMUST00000132069 710 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm11186-201ENSMUST00000137096 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm371-201ENSMUST00000142240 1245 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Vmn1r5-201ENSMUST00000164307 1056 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
H2-M5A7VMS3 Cep41-210ENSMUST00000169422 438 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.6 ms