Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 Gm5086-203ENSMUST00000210897 1136 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr1065-203ENSMUST00000216165 992 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC125019.1-201ENSMUST00000224809 908 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC123867.1-201ENSMUST00000224990 816 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC138604.2-201ENSMUST00000226620 921 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr960-201ENSMUST00000077060 1067 ntAPPRIS P2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm30382-202ENSMUST00000199007 1801 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm35850-201ENSMUST00000210956 4653 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Olfr1238-202ENSMUST00000217226 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC154642.2-201ENSMUST00000223657 2485 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Frmpd4-203ENSMUST00000112147 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Csmd1-201ENSMUST00000082104 14182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 AC155941.4-201ENSMUST00000219731 2705 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 4930471M09Rik-202ENSMUST00000206475 1990 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Gm13043-201ENSMUST00000178489 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Lipf-201ENSMUST00000025680 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 Slc7a11-201ENSMUST00000029297 9223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
Rnf4Q9QZS2 2610203C20Rik-204ENSMUST00000181214 3525 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r58-201ENSMUST00000171671 2589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm43483-201ENSMUST00000196724 2860 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Tsix-201ENSMUST00000152916 4306 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr694-203ENSMUST00000216118 5035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm8113-201ENSMUST00000160298 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Pfkfb2-203ENSMUST00000169659 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm23192-201ENSMUST00000102434 96 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Tmem91-202ENSMUST00000108404 485 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm16044-201ENSMUST00000118475 450 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Fau-ps2-201ENSMUST00000119333 371 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm15586-201ENSMUST00000121218 528 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm11681-201ENSMUST00000127337 870 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Rnf4Q9QZS2 Ighv1-71-201ENSMUST00000166645 302 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm4781-201ENSMUST00000167995 781 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr457-201ENSMUST00000170504 1039 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm6838-201ENSMUST00000172851 582 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm26612-201ENSMUST00000180785 1055 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Mir8114-201ENSMUST00000183582 111 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Rnf4Q9QZS2 Gm28546-201ENSMUST00000188221 615 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm28443-201ENSMUST00000189081 698 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 4930597L12Rik-201ENSMUST00000196286 911 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Rnf4Q9QZS2 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Rnf4Q9QZS2 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
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Rnf4Q9QZS2 Tmem27-202ENSMUST00000112280 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Rnf4Q9QZS2 Gm44769-201ENSMUST00000206120 2809 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Pik3c2g-215ENSMUST00000218528 2712 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Kbtbd3-202ENSMUST00000212221 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Rnf4Q9QZS2 Cyp2c67-201ENSMUST00000067328 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Cyp2c68-201ENSMUST00000099472 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm40893-201ENSMUST00000220507 1508 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
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Rnf4Q9QZS2 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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Rnf4Q9QZS2 Gm44441-201ENSMUST00000203642 2475 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Mob1b-202ENSMUST00000113229 8967 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Clasp1-203ENSMUST00000165223 7207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm43187-201ENSMUST00000200652 2397 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm19667-201ENSMUST00000188984 3334 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Lmbrd1-201ENSMUST00000095062 5228 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Olfr75-ps1-202ENSMUST00000141956 2500 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Trappc2-201ENSMUST00000112192 1294 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm23840-201ENSMUST00000116950 97 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm11241-201ENSMUST00000117371 896 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Cyp4a30-ps-201ENSMUST00000120813 1020 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm11882-201ENSMUST00000121463 506 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Rnf4Q9QZS2 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms