Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

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Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Gm14869-201ENSMUST00000119007 884 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Usp47Q8BY87 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm22728-201ENSMUST00000158087 129 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Obox3-204ENSMUST00000173912 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm8245-201ENSMUST00000182434 987 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm38200-201ENSMUST00000192083 2111 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm43906-201ENSMUST00000203194 906 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm10126-201ENSMUST00000221732 168 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 AC154515.3-201ENSMUST00000225081 1159 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Gm9800-201ENSMUST00000052615 336 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Scml2-205ENSMUST00000101113 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 AC122356.1-202ENSMUST00000227328 2758 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
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Usp47Q8BY87 Zkscan2-201ENSMUST00000042470 7831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Frem3-201ENSMUST00000039695 6384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
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Usp47Q8BY87 Psg26-201ENSMUST00000094798 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Usp47Q8BY87 Clasp1-206ENSMUST00000186349 7281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
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Usp47Q8BY87 Skint1-203ENSMUST00000161389 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Usp47Q8BY87 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Exd1-203ENSMUST00000171024 5290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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Usp47Q8BY87 Cwc22-202ENSMUST00000111818 3255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Zcchc6-201ENSMUST00000071703 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Usp47Q8BY87 4931406B18Rik-203ENSMUST00000163619 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 AC117608.1-201ENSMUST00000225500 3418 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Pmfbp1-201ENSMUST00000034162 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm43507-202ENSMUST00000200281 2011 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Abraxas2-201ENSMUST00000084497 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm6786-201ENSMUST00000203165 1915 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Ppp3r2-201ENSMUST00000029991 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm12468-201ENSMUST00000116189 404 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm14531-201ENSMUST00000120845 285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Usp47Q8BY87 Gm11657-201ENSMUST00000137175 337 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms