Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Sorbs2-220ENSMUST00000139869 4275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Nfib-202ENSMUST00000064770 8429 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14226-201ENSMUST00000130870 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15448-203ENSMUST00000108620 1828 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Eif2s3x-202ENSMUST00000113922 1103 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14048-201ENSMUST00000121864 1268 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15928-201ENSMUST00000122455 280 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 4930594O21Rik-202ENSMUST00000144981 682 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26407-201ENSMUST00000158504 307 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17234-201ENSMUST00000172128 392 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8298-201ENSMUST00000179799 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 1700016L21Rik-202ENSMUST00000189139 629 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37729-201ENSMUST00000194761 1172 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 7420701I03Rik-201ENSMUST00000222157 737 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC131586.4-201ENSMUST00000228424 668 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr610-201ENSMUST00000063109 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r195-201ENSMUST00000091736 1088 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm42820-201ENSMUST00000200084 3063 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Irgm2-203ENSMUST00000209079 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC123705.1-201ENSMUST00000222512 2058 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Unc13b-215ENSMUST00000207569 14754 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ank3-239ENSMUST00000183148 7404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 CT010470.1-201ENSMUST00000225364 1876 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Vmn1r44-204ENSMUST00000226171 1877 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ugt2b37-201ENSMUST00000075858 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14147-201ENSMUST00000109888 2681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8005-201ENSMUST00000167326 1401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Spta1-201ENSMUST00000027817 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 CT025619.3-201ENSMUST00000216299 3267 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Tcf12-221ENSMUST00000185117 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17529-201ENSMUST00000180738 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Ints2-202ENSMUST00000108039 4369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Smad5-202ENSMUST00000109874 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zik1-201ENSMUST00000032551 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20597-201ENSMUST00000218774 5486 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Srrm1-201ENSMUST00000030613 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Il1rl1-201ENSMUST00000053043 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC153955.2-201ENSMUST00000216739 4129 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Txndc16-207ENSMUST00000147853 2816 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zc3h12b-201ENSMUST00000082183 2831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm31343-201ENSMUST00000207967 2454 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Dst-209ENSMUST00000182697 2704 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Ccndbp1Q3TVC7 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
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Ccndbp1Q3TVC7 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 A230072E10Rik-201ENSMUST00000146161 676 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15843-201ENSMUST00000146593 529 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13839-201ENSMUST00000151639 506 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Mgst2-206ENSMUST00000161590 481 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17097-201ENSMUST00000166414 714 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr936-201ENSMUST00000178303 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm27018-201ENSMUST00000181136 225 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5575-201ENSMUST00000190879 398 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6123-201ENSMUST00000193658 1069 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm36943-201ENSMUST00000194422 282 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Hcfc1r1-ps1-201ENSMUST00000198911 346 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43226-201ENSMUST00000202438 259 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC160112.1-201ENSMUST00000219139 714 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 AC132237.3-201ENSMUST00000220867 549 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm19189-201ENSMUST00000221689 754 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr935-201ENSMUST00000080748 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm7493-201ENSMUST00000085919 626 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb37-206ENSMUST00000172044 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
Ccndbp1Q3TVC7 Olfr1160-202ENSMUST00000215457 6042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
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