Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 1700001F09Rik-201ENSMUST00000178178 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm9556-201ENSMUST00000182938 940 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm6931-201ENSMUST00000183103 371 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Mir6403-201ENSMUST00000185007 129 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm3121-201ENSMUST00000187086 406 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm28264-201ENSMUST00000190657 398 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm37024-201ENSMUST00000192224 868 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm7804-201ENSMUST00000192784 738 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm30613-201ENSMUST00000197277 512 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm36278-201ENSMUST00000217030 918 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC163296.1-202ENSMUST00000218395 661 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC163296.1-201ENSMUST00000220004 1266 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC164424.3-201ENSMUST00000220809 148 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC166358.8-201ENSMUST00000223288 105 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC124739.1-201ENSMUST00000223433 148 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC164294.1-201ENSMUST00000224682 688 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC174797.4-201ENSMUST00000225510 347 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC161453.1-201ENSMUST00000226078 884 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC122937.2-201ENSMUST00000228258 1051 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Psmf1-201ENSMUST00000042452 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr1260-201ENSMUST00000061830 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Spink11-201ENSMUST00000097587 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Magea10-201ENSMUST00000088481 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 BC085271-201ENSMUST00000191852 1487 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm37372-201ENSMUST00000193577 3311 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Celf2-214ENSMUST00000170438 8856 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Ldhc-201ENSMUST00000014545 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Sox6-210ENSMUST00000206034 8668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Serpind1-201ENSMUST00000023450 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Ank3-207ENSMUST00000181974 3751 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm35208-201ENSMUST00000221590 1411 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm26555-202ENSMUST00000180882 3726 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Glb1l2-201ENSMUST00000040398 3701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Sdcbp-202ENSMUST00000103008 2086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Usp40-204ENSMUST00000187758 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps34-202ENSMUST00000204750 1671 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Grik1-210ENSMUST00000228034 2708 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Ace2-202ENSMUST00000112271 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 1810013D15Rik-203ENSMUST00000196971 1450 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm23484-201ENSMUST00000104178 131 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm14509-201ENSMUST00000117312 1286 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm11816-202ENSMUST00000149848 714 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm23392-201ENSMUST00000157580 113 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm22094-201ENSMUST00000158976 117 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm21312-202ENSMUST00000180889 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm21304-202ENSMUST00000181059 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 B230104I21Rik-201ENSMUST00000181143 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm8764-202ENSMUST00000181179 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm6763-202ENSMUST00000181287 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm21293-203ENSMUST00000181634 1246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm20765-202ENSMUST00000181703 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Usp39Q3TIX9 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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Usp39Q3TIX9 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 A330076H08Rik-203ENSMUST00000208822 1164 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
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Usp39Q3TIX9 AC160061.1-201ENSMUST00000217766 533 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm17611-202ENSMUST00000220613 814 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Ssbp1-201ENSMUST00000031971 1063 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr125-201ENSMUST00000050255 1118 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr1032-201ENSMUST00000062166 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr888-201ENSMUST00000075228 945 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm904-201ENSMUST00000099519 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC093022.3-201ENSMUST00000226569 1926 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Frs2-201ENSMUST00000020381 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Ermap-206ENSMUST00000138395 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Mcm4-201ENSMUST00000023353 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Usp39Q3TIX9 Svil-201ENSMUST00000025079 7433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
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