Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Pole2-202ENSMUST00000221411 1641 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Slc4a4-201ENSMUST00000113216 2518 ntTSL 1 (best) BASIC7.67□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm44117-201ENSMUST00000204442 1758 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm26849-201ENSMUST00000180561 1842 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 A330058E17Rik-201ENSMUST00000200757 3890 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC129208.1-201ENSMUST00000227474 2906 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15097-201ENSMUST00000101180 2029 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15127-201ENSMUST00000101186 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15091-201ENSMUST00000112740 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15107-201ENSMUST00000112796 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15080-201ENSMUST00000112804 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15109-201ENSMUST00000133085 2026 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Ott-201ENSMUST00000177554 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Ott-202ENSMUST00000177606 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15085-201ENSMUST00000178169 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Ott-203ENSMUST00000179348 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Nol8-205ENSMUST00000222197 4368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Zbtb18-212ENSMUST00000195612 3790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm23437-201ENSMUST00000104036 127 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 S100a1-202ENSMUST00000107340 577 ntTSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm7746-201ENSMUST00000120966 503 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm13899-201ENSMUST00000121519 1255 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15527-201ENSMUST00000138259 858 ntTSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm13389-201ENSMUST00000142774 639 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm7420-201ENSMUST00000162836 842 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm20637-201ENSMUST00000175715 462 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm5039-201ENSMUST00000177747 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Rps12-ps22-201ENSMUST00000179382 402 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm8332-201ENSMUST00000179468 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm2035-201ENSMUST00000180053 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm9423-201ENSMUST00000183173 997 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm29143-201ENSMUST00000189462 201 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 1700027F09Rik-201ENSMUST00000189767 767 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm7341-201ENSMUST00000192183 926 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm43928-201ENSMUST00000203737 409 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm44836-201ENSMUST00000205869 336 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm45478-201ENSMUST00000209472 211 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr687-202ENSMUST00000218046 1004 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC192091.1-201ENSMUST00000218668 439 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC160863.3-201ENSMUST00000220129 1228 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm21936-201ENSMUST00000221442 435 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 CT009711.2-202ENSMUST00000224538 973 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC157572.1-201ENSMUST00000227187 825 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Rps27rt-201ENSMUST00000053150 374 ntAPPRIS P1 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 AC159193.3-201ENSMUST00000221902 2622 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm38288-201ENSMUST00000195330 1320 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Pogz-203ENSMUST00000107266 4100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm18537-202ENSMUST00000206215 1503 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm6509-202ENSMUST00000201552 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Zbed4-ps3-201ENSMUST00000187149 3244 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Cabyr-207ENSMUST00000191078 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 9030607J07Rik-201ENSMUST00000202228 1622 ntBASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Acox3-210ENSMUST00000202266 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gimap4-202ENSMUST00000090070 1804 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr538-202ENSMUST00000210973 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Plxdc2-202ENSMUST00000114702 2146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gjc1-203ENSMUST00000107075 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Tcf4-202ENSMUST00000078486 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Stxbp4-202ENSMUST00000107872 2529 ntTSL 1 (best) BASIC7.66□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Ston1-201ENSMUST00000064035 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Trp63-205ENSMUST00000115306 4691 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Rapgef5-201ENSMUST00000109691 6746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Celf2-204ENSMUST00000114924 8738 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Ighv11-2-201ENSMUST00000103468 461 ntAPPRIS P1 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Itch-202ENSMUST00000109685 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Fmo4-202ENSMUST00000111525 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Abraxas1-203ENSMUST00000117364 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm13130-201ENSMUST00000119195 1166 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm16056-201ENSMUST00000119293 135 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15129-201ENSMUST00000119673 279 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm14728-201ENSMUST00000122196 492 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm13856-201ENSMUST00000126498 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 8030451A03Rik-203ENSMUST00000141428 2618 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm12031-201ENSMUST00000156150 627 ntTSL 2 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Agbl1-203ENSMUST00000156166 3369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 4933411E06Rik-201ENSMUST00000186016 1493 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
Trim71Q1PSW8 Gm9127-201ENSMUST00000188041 985 ntBASIC7.65□□□□□ -1.18
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