Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zim1-201ENSMUST00000002336 7693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm23701-201ENSMUST00000103893 110 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm11810-201ENSMUST00000118311 333 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm11838-201ENSMUST00000121999 231 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 H2-T24-202ENSMUST00000174063 884 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm20638-201ENSMUST00000175796 550 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm6176-201ENSMUST00000178209 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm7978-201ENSMUST00000178552 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm4567-201ENSMUST00000178591 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm10668-201ENSMUST00000179491 906 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm29175-201ENSMUST00000189500 402 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm4545-201ENSMUST00000190797 603 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm38022-201ENSMUST00000191762 403 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm37825-201ENSMUST00000193141 904 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Kitl-201ENSMUST00000020129 1260 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm44553-201ENSMUST00000206316 2037 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm30692-201ENSMUST00000208709 801 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Ctxn3-203ENSMUST00000209786 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm7151-201ENSMUST00000211511 954 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm13769-201ENSMUST00000077123 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Cyp2b23-201ENSMUST00000077356 2189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm24613-201ENSMUST00000083266 130 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zc4h2-201ENSMUST00000044382 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gucy1b2-201ENSMUST00000022501 2711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Tmem232-202ENSMUST00000086722 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm10439-201ENSMUST00000101181 1977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Acp2-201ENSMUST00000002172 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm3460-201ENSMUST00000167882 1809 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
SbdsP70122 4933425L06Rik-201ENSMUST00000022232 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm15093-201ENSMUST00000179021 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm26945-201ENSMUST00000183191 2011 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Cfap54-211ENSMUST00000212902 9516 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm11855-201ENSMUST00000121562 1869 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC156636.1-201ENSMUST00000218639 2229 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Fut9-201ENSMUST00000084770 12134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Mak-206ENSMUST00000225084 3573 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm16506-201ENSMUST00000165553 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Slc17a3-202ENSMUST00000091698 1759 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 AC158988.1-201ENSMUST00000226731 2624 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm14664-201ENSMUST00000142919 437 ntTSL 3 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm8093-203ENSMUST00000144982 1020 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Casp12-204ENSMUST00000151332 1065 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm22882-201ENSMUST00000157749 124 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm8893-201ENSMUST00000172146 1242 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm26197-201ENSMUST00000175033 115 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Trav7n-6-201ENSMUST00000178100 381 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm18351-201ENSMUST00000188646 883 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm43515-201ENSMUST00000197930 2141 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm17660-203ENSMUST00000198485 522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm36231-201ENSMUST00000211183 217 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 1810014B01Rik-204ENSMUST00000218536 204 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Olfr761-201ENSMUST00000049620 1029 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Olfr127-201ENSMUST00000076331 1095 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Slxl1-201ENSMUST00000088740 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm37033-201ENSMUST00000193199 7350 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Olfr93-203ENSMUST00000219235 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Sspo-201ENSMUST00000043676 15148 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zfp143-205ENSMUST00000211798 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm13571-201ENSMUST00000124654 1381 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Nek7-203ENSMUST00000187407 4336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SbdsP70122 5430427O19Rik-201ENSMUST00000113976 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Pcdh15-205ENSMUST00000105429 6719 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm9752-201ENSMUST00000048965 2659 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Zfp712-201ENSMUST00000167565 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.21
SbdsP70122 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
SbdsP70122 Olfr472-203ENSMUST00000216937 5392 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Mgst1-202ENSMUST00000118091 1030 ntTSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm6491-201ENSMUST00000118273 990 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Olfr602-ps1-201ENSMUST00000118403 948 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm11320-201ENSMUST00000119434 463 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Mgst1-203ENSMUST00000120230 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
SbdsP70122 4930483K19Rik-201ENSMUST00000127576 1237 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms