Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm26671-201ENSMUST00000180423 1157 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm28573-201ENSMUST00000187821 380 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm28145-201ENSMUST00000189742 380 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm28400-201ENSMUST00000191332 380 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm1647-201ENSMUST00000195406 735 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Olfr97-202ENSMUST00000207414 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Olfr1251-203ENSMUST00000214750 1040 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 AC152819.1-201ENSMUST00000220435 871 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 AC152940.1-201ENSMUST00000226504 139 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Nup43-201ENSMUST00000040135 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Zfp982-201ENSMUST00000063704 1244 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Olfr771-201ENSMUST00000078914 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm25852-201ENSMUST00000082790 130 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm24924-201ENSMUST00000084007 164 ntBASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Gm6567-201ENSMUST00000205529 2095 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Olfr324-203ENSMUST00000216965 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Slc22a19-201ENSMUST00000025666 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
SrprbP47758 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 4930590J08Rik-203ENSMUST00000205686 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Slc6a19-201ENSMUST00000022048 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Ikbkg-217ENSMUST00000164101 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Ikbkg-218ENSMUST00000180230 6785 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Prickle2-204ENSMUST00000113447 7679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm45902-201ENSMUST00000124331 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Mkks-201ENSMUST00000028730 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm13102-202ENSMUST00000097800 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Prdx6b-201ENSMUST00000057072 2885 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm31410-201ENSMUST00000217302 4048 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Mast4-201ENSMUST00000099202 7709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Rbms3-202ENSMUST00000068962 3320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm37151-201ENSMUST00000194631 5007 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Usp17ld-201ENSMUST00000073394 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm19583-201ENSMUST00000202993 1366 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Olfr1232-202ENSMUST00000213860 2413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 2610524H06Rik-201ENSMUST00000100850 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm22470-201ENSMUST00000104117 130 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm13776-201ENSMUST00000122236 1261 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm22024-201ENSMUST00000122733 287 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Hnf1aos1-203ENSMUST00000131845 740 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm2709-201ENSMUST00000142979 350 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm26182-201ENSMUST00000157688 116 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Olfr443-ps1-201ENSMUST00000163240 915 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm17711-201ENSMUST00000172028 237 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Sbp-202ENSMUST00000181985 920 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm27373-201ENSMUST00000184017 184 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 C430002N11Rik-202ENSMUST00000189067 1029 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm42650-201ENSMUST00000197038 575 ntTSL 2 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm42558-201ENSMUST00000200982 265 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Olfr440-ps1-201ENSMUST00000204044 917 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm45198-201ENSMUST00000206796 591 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm34533-201ENSMUST00000209249 552 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm7419-201ENSMUST00000209962 925 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm45497-201ENSMUST00000211701 740 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 AC153897.1-201ENSMUST00000213510 470 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm3428-204ENSMUST00000214488 1020 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 6030440G07Rik-201ENSMUST00000221849 1090 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Olfr648-201ENSMUST00000052659 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm5426-201ENSMUST00000074615 312 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 n-R5s60-201ENSMUST00000083299 119 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Teddm1b-201ENSMUST00000055314 2527 ntAPPRIS P1 BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Pcdh15-227ENSMUST00000152655 3860 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Ago3-201ENSMUST00000069097 15595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Slc26a2-201ENSMUST00000037603 2802 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Rftn2-201ENSMUST00000027121 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Pank1-202ENSMUST00000112460 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
SrprbP47758 4921509C19Rik-201ENSMUST00000080132 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Cep170-212ENSMUST00000194727 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.38□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
SrprbP47758 Gm44898-201ENSMUST00000205934 2223 ntBASIC8.38□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.7 ms