Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Irgm1-201ENSMUST00000049519 2259 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Odf2l-203ENSMUST00000098539 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm11282-201ENSMUST00000119018 1416 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Nos2-201ENSMUST00000018610 4192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm13301-201ENSMUST00000121728 2446 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Olfr332-201ENSMUST00000180165 3426 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm26967-201ENSMUST00000182878 2303 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Tnr-202ENSMUST00000192069 12202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Sap30bp-203ENSMUST00000140991 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Snhg17-209ENSMUST00000186993 3144 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Cd69-201ENSMUST00000032259 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Nexn-201ENSMUST00000046045 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Exoc2-202ENSMUST00000102946 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Aadat-202ENSMUST00000209338 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Prg4-203ENSMUST00000111902 3636 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm37147-201ENSMUST00000193756 1498 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 2810021J22Rik-201ENSMUST00000073924 3866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Masp1-201ENSMUST00000089883 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm11880-201ENSMUST00000117612 399 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm15644-201ENSMUST00000121764 387 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Fcor-201ENSMUST00000159364 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm17233-201ENSMUST00000168470 698 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm26729-201ENSMUST00000180744 352 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Mir6409-201ENSMUST00000184957 92 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm28416-201ENSMUST00000188334 292 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Ly6g-202ENSMUST00000190262 941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm37977-201ENSMUST00000193096 721 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Trav7-1-201ENSMUST00000198019 337 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm43235-201ENSMUST00000200121 297 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm36827-201ENSMUST00000220080 1249 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 1700026J12Rik-201ENSMUST00000098226 1127 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm44669-201ENSMUST00000207774 1969 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Igf1os-202ENSMUST00000146581 2595 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm37783-201ENSMUST00000192025 1856 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Phc1-208ENSMUST00000160696 4213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Ganab-201ENSMUST00000096246 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Hcrtr2-201ENSMUST00000063140 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Apol10a-202ENSMUST00000119997 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm43537-201ENSMUST00000199064 3110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm45843-201ENSMUST00000212317 4597 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Glrx-201ENSMUST00000022082 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm42930-201ENSMUST00000200872 3260 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Primpol-206ENSMUST00000209787 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Mir99ahg-208ENSMUST00000182748 3151 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Meis2-206ENSMUST00000110908 3697 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Nup93-202ENSMUST00000109547 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Vmn1r22-201ENSMUST00000227342 3057 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Vmn1r22-204ENSMUST00000228257 3079 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Epc1-203ENSMUST00000115870 3817 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Bnip3l-201ENSMUST00000022634 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Vmn1r181-208ENSMUST00000228842 4491 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 CT025639.1-201ENSMUST00000223906 1375 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm10258-201ENSMUST00000091270 2123 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Birc6-223ENSMUST00000183224 14562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Sbf2-208ENSMUST00000166020 5481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Ap3s1-ps1-201ENSMUST00000117113 579 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm13038-201ENSMUST00000119886 459 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm11267-201ENSMUST00000137477 1071 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm15275-201ENSMUST00000154752 347 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm22206-201ENSMUST00000158612 116 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Ap3s1-ps2-201ENSMUST00000178107 579 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm17660-202ENSMUST00000178967 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 4931428L18Rik-203ENSMUST00000187659 423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 4930403P22Rik-201ENSMUST00000192234 713 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 C920008G01Rik-201ENSMUST00000196756 380 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm32816-202ENSMUST00000206497 496 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 E230032D23Rik-202ENSMUST00000207959 451 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 4933431C10Rik-201ENSMUST00000208973 1266 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 Gm36719-201ENSMUST00000219518 927 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 AC126554.3-201ENSMUST00000223131 493 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Pou5f1P20263 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms