Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Mup16-202ENSMUST00000107483 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mup17-201ENSMUST00000107484 927 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm13137-201ENSMUST00000118035 345 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Rpl23a-ps2-201ENSMUST00000119375 474 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm2735-201ENSMUST00000136133 277 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm23276-201ENSMUST00000157913 138 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Phf11d-203ENSMUST00000161031 1130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm7678-201ENSMUST00000181879 943 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mir6919-201ENSMUST00000185146 62 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm5147-201ENSMUST00000185999 794 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 4933417E11Rik-201ENSMUST00000188213 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Avpr1b-202ENSMUST00000190410 623 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm18131-201ENSMUST00000199241 449 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm42472-201ENSMUST00000201626 859 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm43905-201ENSMUST00000204516 204 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm35024-201ENSMUST00000213359 972 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC118476.2-201ENSMUST00000215206 757 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 CT485606.3-201ENSMUST00000215810 624 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC131912.1-201ENSMUST00000217527 290 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 4930477G07Rik-202ENSMUST00000223195 947 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC158981.1-201ENSMUST00000226943 1205 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mphosph6-201ENSMUST00000034303 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mup2-201ENSMUST00000074700 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mup7-201ENSMUST00000079697 927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Mup19-201ENSMUST00000080606 927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm22053-201ENSMUST00000083394 200 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Car1-201ENSMUST00000094365 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Scn8a-202ENSMUST00000096198 1072 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Lrrc63-201ENSMUST00000022574 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC174797.5-201ENSMUST00000225055 1860 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm26861-201ENSMUST00000180807 5278 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Dcdc5-201ENSMUST00000037284 3093 ntTSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Vmn2r45-201ENSMUST00000164845 3619 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm42885-201ENSMUST00000200763 4214 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Yme1l1-201ENSMUST00000028117 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Zdhhc11-201ENSMUST00000091493 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm37525-201ENSMUST00000193499 2871 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Vmn1r51-201ENSMUST00000072859 2567 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Cdc42-201ENSMUST00000030417 1448 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 4930544G11Rik-201ENSMUST00000043382 1406 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Tbp-211ENSMUST00000162505 12794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Lonrf2-201ENSMUST00000039612 5077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Tsr1-201ENSMUST00000045807 3389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Alpk1-206ENSMUST00000198955 4498 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr66-202ENSMUST00000216303 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Zfp459-201ENSMUST00000056470 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Zfp263-207ENSMUST00000162207 2452 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Trrap-203ENSMUST00000100467 12479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Trrap-202ENSMUST00000094120 12456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm28819-202ENSMUST00000187416 1335 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm37077-201ENSMUST00000195723 3691 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Cpsf6-201ENSMUST00000069168 6526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr1426-203ENSMUST00000217952 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Igkv12-46-201ENSMUST00000103365 377 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Trdv2-2-201ENSMUST00000103678 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm25167-201ENSMUST00000104188 120 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm11203-201ENSMUST00000122169 741 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Zfp113-202ENSMUST00000132318 488 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 4933401B06Rik-202ENSMUST00000142024 1219 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 9530046B11Rik-201ENSMUST00000149413 1157 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm16333-201ENSMUST00000161416 318 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Trav9d-4-201ENSMUST00000167409 307 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 BC065403-202ENSMUST00000184796 1043 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm20111-201ENSMUST00000184830 319 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 1700006H21Rik-201ENSMUST00000188490 627 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 9530018H14Rik-201ENSMUST00000192253 1243 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm26672-203ENSMUST00000192501 756 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Rps4x-ps-201ENSMUST00000199852 793 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 9530013L04Rik-201ENSMUST00000203393 782 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Olfr1345-ps1-201ENSMUST00000210627 244 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm5119-201ENSMUST00000215858 634 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Gm5080-201ENSMUST00000220341 743 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Vpreb3-201ENSMUST00000000926 625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 5430421F17Rik-202ENSMUST00000210268 2295 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Cntn4-204ENSMUST00000113260 2531 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Aox4-201ENSMUST00000040442 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
H2-Eb1P04230 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
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