Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Klra13-ps-203ENSMUST00000204367 850 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Akr1c12-201ENSMUST00000021632 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC159462.2-201ENSMUST00000217559 463 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 CT025639.2-201ENSMUST00000224440 1220 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC161595.1-201ENSMUST00000216389 1993 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Agtpbp1-201ENSMUST00000022040 8174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Celf2-206ENSMUST00000114934 5470 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Dip2b-203ENSMUST00000108971 8127 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 C2cd3-201ENSMUST00000051777 7803 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Zbbx-201ENSMUST00000039269 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Elmod2-201ENSMUST00000053902 4319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm29220-201ENSMUST00000185862 1501 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm28966-201ENSMUST00000188951 1501 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Ppp1r9a-212ENSMUST00000177456 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm45163-201ENSMUST00000207606 3987 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm8279-202ENSMUST00000165713 1760 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm5795-203ENSMUST00000171150 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Nol8-203ENSMUST00000221142 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Pramel4-202ENSMUST00000091676 2399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Exoc1-201ENSMUST00000049469 3272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 E330035G20Rik-202ENSMUST00000223323 3578 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Igkv14-126-201ENSMUST00000103310 358 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Rps12-ps5-201ENSMUST00000118272 389 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm13525-201ENSMUST00000120607 478 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm26323-201ENSMUST00000157743 175 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Clec2i-204ENSMUST00000160867 933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Clec2i-205ENSMUST00000162666 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Arpp19-204ENSMUST00000167885 540 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm28644-201ENSMUST00000191364 585 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm43192-201ENSMUST00000198002 637 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm4270-201ENSMUST00000209666 406 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm36435-201ENSMUST00000213341 1178 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Akr1c21-201ENSMUST00000021628 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Vmn1r41-202ENSMUST00000226337 888 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Vmn1r41-203ENSMUST00000226562 1046 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC139209.2-201ENSMUST00000227680 1208 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Clec2i-201ENSMUST00000032519 1014 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Tas2r144-201ENSMUST00000063489 960 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr1385-201ENSMUST00000071807 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Rhox4b-201ENSMUST00000096458 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gpr165-201ENSMUST00000033554 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Enpep-201ENSMUST00000029658 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Nat8f4-201ENSMUST00000095757 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 4930428E07Rik-202ENSMUST00000222922 3799 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Prkd3-201ENSMUST00000003191 5517 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm1141-201ENSMUST00000101495 2147 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Olfr480-202ENSMUST00000217653 1876 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gucy1b3-201ENSMUST00000029635 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 AC132465.2-201ENSMUST00000218673 2728 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Vmn1r184-205ENSMUST00000227790 4334 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm28311-201ENSMUST00000185236 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm28549-202ENSMUST00000191354 1497 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Vmn2r-ps103-201ENSMUST00000222960 2349 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Cdk14-204ENSMUST00000115452 1567 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Abca17-202ENSMUST00000121226 5317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Arid5b-203ENSMUST00000218532 3025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 2310039L15Rik-202ENSMUST00000219492 3743 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Itgae-201ENSMUST00000006101 3845 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm14280-201ENSMUST00000138080 1444 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Slc12a8-205ENSMUST00000122314 2819 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 4930590J08Rik-201ENSMUST00000059318 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Cept1-202ENSMUST00000068301 2814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Pabpc4l-202ENSMUST00000192793 5252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Omg-201ENSMUST00000164465 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Tshr-202ENSMUST00000021346 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm28587-201ENSMUST00000187181 3005 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm42711-201ENSMUST00000197060 2302 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm22671-201ENSMUST00000104420 134 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Smim8-205ENSMUST00000108134 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 9630041A04Rik-201ENSMUST00000112841 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm15203-201ENSMUST00000117668 455 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm13878-201ENSMUST00000117986 577 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm23079-201ENSMUST00000157847 117 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Gm22948-201ENSMUST00000158561 243 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Esd-203ENSMUST00000175887 809 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 Ank3-228ENSMUST00000182692 3833 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Ifnb1P01575 4930568A12Rik-201ENSMUST00000186117 498 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms