Protein–RNA interactions for Protein: G3UXB3

Nkx1-1, NK1 homeobox 1, mousemouse

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Length 402 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-1G3UXB3 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Olfr1424-202ENSMUST00000207681 1714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 5730455P16Rik-201ENSMUST00000103225 4554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Rbm27-201ENSMUST00000046972 6134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm36325-201ENSMUST00000210487 2885 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Hspd1-ps2-201ENSMUST00000210003 1697 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Papola-215ENSMUST00000170002 2605 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm8428-201ENSMUST00000159919 1784 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm525-201ENSMUST00000100619 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm24433-201ENSMUST00000104080 133 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gmfg-203ENSMUST00000108292 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm13064-201ENSMUST00000119125 557 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm11352-201ENSMUST00000119264 517 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm11712-201ENSMUST00000129139 367 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm11545-201ENSMUST00000146507 375 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm13662-201ENSMUST00000157059 712 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm23703-201ENSMUST00000158839 143 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm16101-201ENSMUST00000160695 430 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Slc15a2-212ENSMUST00000168279 958 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm17051-201ENSMUST00000170787 487 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm11168-202ENSMUST00000178077 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 1700012D16Rik-201ENSMUST00000197231 577 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm43033-201ENSMUST00000199682 425 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm42965-201ENSMUST00000201254 250 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm2796-201ENSMUST00000204007 496 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm30646-201ENSMUST00000207662 180 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm44833-201ENSMUST00000208368 331 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm39336-201ENSMUST00000214933 260 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm34005-201ENSMUST00000215834 282 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Olfr746-202ENSMUST00000218546 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm7413-201ENSMUST00000219498 462 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Ndufa4-201ENSMUST00000031637 468 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm4924-201ENSMUST00000165906 2645 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Ppfibp1-202ENSMUST00000111623 4782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm28410-201ENSMUST00000188113 1450 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Wdr35-201ENSMUST00000085745 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Hsp90aa1-202ENSMUST00000094361 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm38387-201ENSMUST00000191945 2577 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Kcne4-201ENSMUST00000057262 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 A830019P07Rik-201ENSMUST00000178904 1777 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Olfr136-203ENSMUST00000208539 1773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Eci2-213ENSMUST00000178421 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Csgalnact1-201ENSMUST00000078350 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Igbp1-201ENSMUST00000033570 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Nkx1-1G3UXB3 Gm40020-201ENSMUST00000215677 1635 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Zfp442-202ENSMUST00000185796 1833 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm4789-201ENSMUST00000121708 1216 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Sms-ps-201ENSMUST00000121773 1101 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm13052-201ENSMUST00000125582 769 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm12089-201ENSMUST00000138402 428 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm17062-201ENSMUST00000166987 461 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm7191-201ENSMUST00000182678 990 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm19872-201ENSMUST00000183446 687 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm28888-201ENSMUST00000186556 316 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Nabp1-207ENSMUST00000188204 972 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm29201-201ENSMUST00000189120 431 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm17970-201ENSMUST00000192199 685 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm37501-201ENSMUST00000192830 691 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm42628-201ENSMUST00000198498 764 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm4873-201ENSMUST00000199402 1203 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 A730082K24Rik-202ENSMUST00000205795 658 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Nkx1-1G3UXB3 4933430N04Rik-202ENSMUST00000208031 1146 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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