Protein–RNA interactions for Protein: A2BED8

Samt1, Predicted gene 10057, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt1A2BED8 Acaca-202ENSMUST00000103201 9513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Slc51a-201ENSMUST00000042042 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr1410-203ENSMUST00000217316 7927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 1700015I17Rik-201ENSMUST00000209585 2099 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Obox2-201ENSMUST00000036575 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Sin3a-204ENSMUST00000167715 4961 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Vmn1r184-203ENSMUST00000227232 8472 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Slc15a1-201ENSMUST00000088386 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr449-202ENSMUST00000204072 1974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm42994-201ENSMUST00000195964 2549 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Kyat3-202ENSMUST00000106218 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr432-203ENSMUST00000213381 4533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Mad2l1-202ENSMUST00000116605 7557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr167-202ENSMUST00000214315 7435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm24334-201ENSMUST00000104210 128 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Pex3-203ENSMUST00000105541 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm4911-201ENSMUST00000119388 945 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm15007-201ENSMUST00000119982 710 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm14380-201ENSMUST00000122298 431 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm28053-201ENSMUST00000127537 350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm11789-205ENSMUST00000148579 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm16573-203ENSMUST00000162231 807 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Mir3078-201ENSMUST00000175231 87 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm22569-201ENSMUST00000175545 124 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm9399-201ENSMUST00000175771 639 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 n-R5s115-201ENSMUST00000179019 119 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm28421-201ENSMUST00000186378 356 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm28355-201ENSMUST00000187443 356 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 1700021A07Rik-202ENSMUST00000187763 485 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm34217-201ENSMUST00000193562 356 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm42808-201ENSMUST00000198212 285 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Tmigd3-206ENSMUST00000199977 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 D830044I16Rik-203ENSMUST00000205437 1016 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 2310008N11Rik-202ENSMUST00000210263 422 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm45283-201ENSMUST00000210593 628 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 AC122356.2-201ENSMUST00000226962 820 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Tti1-201ENSMUST00000029179 3830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Chn1-201ENSMUST00000070579 1023 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm24143-201ENSMUST00000082633 145 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 n-R5s193-201ENSMUST00000082864 109 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Klk1b3-201ENSMUST00000085450 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Olfr1284-201ENSMUST00000062407 1774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Hydin-201ENSMUST00000043141 15783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Ino80d-201ENSMUST00000097718 13675 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Ms4a4c-201ENSMUST00000072729 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Pfkfb1-201ENSMUST00000080884 1739 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Parp8-201ENSMUST00000022239 3098 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Gm46136-202ENSMUST00000217053 6329 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Samt1A2BED8 Vps13c-201ENSMUST00000077879 11527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 BC035044-201ENSMUST00000160290 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Olfr596-202ENSMUST00000214577 3392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm13102-201ENSMUST00000097799 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Prrc2c-209ENSMUST00000182593 9022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Olfr615-203ENSMUST00000215673 3469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Kcnu1-202ENSMUST00000120653 1446 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 AC166341.5-201ENSMUST00000222206 1400 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Nlrp1c-ps-202ENSMUST00000174668 3422 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 4921518K17Rik-201ENSMUST00000143949 3390 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm3424-201ENSMUST00000164585 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm3182-201ENSMUST00000167902 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm8246-202ENSMUST00000180788 1753 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Eci2-203ENSMUST00000110251 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Mterf1b-201ENSMUST00000177258 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm43335-201ENSMUST00000198299 3276 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm8257-202ENSMUST00000169583 1749 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Vmn2r41-201ENSMUST00000168807 3617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Fam83b-202ENSMUST00000183437 3879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm22150-201ENSMUST00000104447 135 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm24071-201ENSMUST00000104520 132 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Ccdc47-202ENSMUST00000106865 704 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Armt1-202ENSMUST00000117489 680 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm13325-201ENSMUST00000118746 806 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm11416-201ENSMUST00000119111 863 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm15753-201ENSMUST00000119241 1062 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 0610043K17Rik-201ENSMUST00000123107 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Pabpn1-203ENSMUST00000139985 903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 C330019F10Rik-201ENSMUST00000149428 459 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm12526-201ENSMUST00000154462 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm13012-202ENSMUST00000155349 849 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm25721-201ENSMUST00000157496 171 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 4931403E22Rik-201ENSMUST00000177048 668 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Six3os1-213ENSMUST00000177487 537 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm6098-201ENSMUST00000180234 330 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 A530083I20Rik-202ENSMUST00000180877 1022 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Gm8357-201ENSMUST00000181115 1011 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Samt1A2BED8 Scgb1b25-ps-201ENSMUST00000186419 415 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms