Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 H3f3a-ps1-201ENSMUST00000119546 410 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm10639-201ENSMUST00000119823 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13495-201ENSMUST00000121156 537 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14826-201ENSMUST00000121284 901 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14156-201ENSMUST00000121538 483 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 BC016548-201ENSMUST00000144657 640 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Ttc39aos1-201ENSMUST00000150239 796 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26357-201ENSMUST00000158218 115 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15882-201ENSMUST00000161344 855 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7707-201ENSMUST00000165950 1156 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm22408-201ENSMUST00000174925 65 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28869-201ENSMUST00000187199 811 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5334-201ENSMUST00000187472 720 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21577-201ENSMUST00000190823 697 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm22149-202ENSMUST00000196259 137 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 C030032O16Rik-201ENSMUST00000196427 716 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42823-201ENSMUST00000197975 256 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5586-201ENSMUST00000206264 795 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 AC147615.1-201ENSMUST00000218914 441 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm40853-201ENSMUST00000221342 582 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 AC163651.1-201ENSMUST00000222500 372 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9255-201ENSMUST00000223225 581 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 AC162183.1-201ENSMUST00000224843 472 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 AC154562.1-201ENSMUST00000226140 966 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 AC161537.1-202ENSMUST00000228450 868 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr715-201ENSMUST00000076958 1131 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr224-201ENSMUST00000081102 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6502-201ENSMUST00000086050 1533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Armc2-203ENSMUST00000160262 4810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Ifi44l-201ENSMUST00000046739 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Wdr76-204ENSMUST00000110603 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Strada-203ENSMUST00000106867 3386 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn1r70-204ENSMUST00000228090 3185 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Dph5-201ENSMUST00000043342 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Serpina3c-201ENSMUST00000085050 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrcc1-206ENSMUST00000169079 5638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Calcr-205ENSMUST00000171613 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp58-204ENSMUST00000171518 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Ncapg-201ENSMUST00000117396 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5087-201ENSMUST00000060526 1921 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Carf-206ENSMUST00000180952 2157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm1965-202ENSMUST00000161362 2405 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37080-201ENSMUST00000194804 2404 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Igkv8-30-201ENSMUST00000103378 368 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm24373-201ENSMUST00000104393 132 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Amelx-203ENSMUST00000112119 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15006-201ENSMUST00000121419 1122 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gimap6-203ENSMUST00000126422 425 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15345-201ENSMUST00000128240 663 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm13964-201ENSMUST00000133815 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15279-201ENSMUST00000155593 288 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17057-201ENSMUST00000169887 591 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn2r-ps60-201ENSMUST00000173296 897 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Vmn2r-ps134-201ENSMUST00000176907 1046 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm21971-201ENSMUST00000180187 337 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26812-201ENSMUST00000181647 328 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7763-201ENSMUST00000182220 1006 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm27153-201ENSMUST00000184492 407 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm28535-201ENSMUST00000188069 885 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm3489-201ENSMUST00000190083 528 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38006-201ENSMUST00000192421 697 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7369-201ENSMUST00000192738 936 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37072-201ENSMUST00000194570 837 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7542-201ENSMUST00000201140 777 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Tex26-207ENSMUST00000202920 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm45525-201ENSMUST00000210800 389 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 1700014L14Rik-201ENSMUST00000211704 481 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 AC154264.1-201ENSMUST00000216064 386 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 1700124M09Rik-201ENSMUST00000217047 305 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7392-201ENSMUST00000217815 345 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 AL590616.1-201ENSMUST00000223339 574 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Wfdc13-201ENSMUST00000088260 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 B230118H07Rik-201ENSMUST00000090513 969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr676-201ENSMUST00000098162 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6493-201ENSMUST00000159889 1786 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Zscan4b-202ENSMUST00000210847 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr982-201ENSMUST00000054051 5576 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 4930545L23Rik-201ENSMUST00000138303 2502 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Adgrg6-201ENSMUST00000041168 6507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Slc25a53-203ENSMUST00000113070 3140 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Olfr1239-202ENSMUST00000216762 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Calcrl-201ENSMUST00000074262 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 0610037L13Rik-212ENSMUST00000135454 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Dync1i2-204ENSMUST00000112138 2466 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Pdpk1Q9Z2A0 Gucy1a3-201ENSMUST00000048976 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.2 ms