Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 9230106D20Rik-201ENSMUST00000052806 1406 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 3830406C13Rik-206ENSMUST00000223762 2292 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Prkaa1-202ENSMUST00000228218 4618 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Kcnmb2-204ENSMUST00000191869 1552 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Atxn7l1-208ENSMUST00000136644 3155 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Epb41-201ENSMUST00000030739 6565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Tmem35a-201ENSMUST00000037687 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gsdmc4-201ENSMUST00000063530 1988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Zzz3-203ENSMUST00000106101 7539 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Fam60a-209ENSMUST00000203164 2442 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Tdrkh-205ENSMUST00000197495 2476 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm25760-201ENSMUST00000103989 132 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm13030-201ENSMUST00000105805 655 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Selenof-202ENSMUST00000106211 1178 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Rhox4g-201ENSMUST00000115166 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm15484-201ENSMUST00000118871 828 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm11343-201ENSMUST00000120579 599 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm23657-201ENSMUST00000122623 294 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm10130-201ENSMUST00000133235 303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm24682-201ENSMUST00000158764 137 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm42421-201ENSMUST00000172367 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm23018-201ENSMUST00000177928 109 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Rhox4a2-201ENSMUST00000179915 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 AV026068-205ENSMUST00000186386 762 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm28817-201ENSMUST00000187598 830 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm28439-201ENSMUST00000187714 876 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 AC153816.1-201ENSMUST00000217870 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 AC127224.1-201ENSMUST00000218094 453 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm19217-201ENSMUST00000218238 328 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Gm18960-201ENSMUST00000222962 713 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 AC159188.3-201ENSMUST00000224199 880 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 4930542C16Rik-201ENSMUST00000062438 1090 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Rhox4e-201ENSMUST00000089075 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Olfr547-201ENSMUST00000098229 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Card11Q8CIS0 Tph2-201ENSMUST00000006949 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm40778-201ENSMUST00000217825 1344 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Apbb1ip-201ENSMUST00000014290 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm15575-201ENSMUST00000119414 1581 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Olfr1198-203ENSMUST00000215529 3413 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 AC153945.1-201ENSMUST00000217761 1722 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm5175-201ENSMUST00000218458 1703 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Slfn9-201ENSMUST00000038211 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Zfp60-202ENSMUST00000108336 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Zp2-205ENSMUST00000208874 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Sv2c-201ENSMUST00000161263 9101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 AC124572.1-201ENSMUST00000218155 2406 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm28651-202ENSMUST00000227968 2693 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Ttk-202ENSMUST00000185913 2731 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Zfp14-202ENSMUST00000207072 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Olfr701-201ENSMUST00000075414 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Pus7-204ENSMUST00000131992 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Hook3-201ENSMUST00000037182 12836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Ighv1-19-201ENSMUST00000103505 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Rpl31-ps10-201ENSMUST00000116034 378 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm9311-201ENSMUST00000118042 1269 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Rpl31-ps11-201ENSMUST00000119898 377 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Rpl31-ps12-201ENSMUST00000119957 375 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm6640-201ENSMUST00000120629 1587 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 4930527B05Rik-201ENSMUST00000141593 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm3208-201ENSMUST00000168281 427 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Ndufb8-209ENSMUST00000171415 2142 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm10687-201ENSMUST00000180670 3233 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Rpl31-ps8-201ENSMUST00000181935 378 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Ccl2-201ENSMUST00000000193 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Trbv27-201ENSMUST00000193711 277 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Rpl31-206ENSMUST00000195123 356 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm8182-201ENSMUST00000197863 769 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 4930553P18Rik-201ENSMUST00000201164 1659 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm8479-201ENSMUST00000203825 718 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm45864-201ENSMUST00000211965 1019 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 AC159542.1-201ENSMUST00000218201 450 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Gm19801-201ENSMUST00000218231 1882 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 4930563J15Rik-202ENSMUST00000219752 560 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Rapgef5-205ENSMUST00000222105 2677 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Sprr2a1-201ENSMUST00000074449 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Rpl31-ps4-201ENSMUST00000079114 390 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Snrpb2-201ENSMUST00000008477 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Rpl31-ps9-201ENSMUST00000086596 378 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Rreb1-210ENSMUST00000149745 4320 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Zfp180-205ENSMUST00000207002 3690 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Armc8-203ENSMUST00000186049 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Card11Q8CIS0 Frmd4b-204ENSMUST00000113359 4311 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms