Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Ddx18-201ENSMUST00000001724 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm37043-201ENSMUST00000194609 3105 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Ccdc158-201ENSMUST00000060930 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 6530403H02Rik-202ENSMUST00000182124 3191 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Pcdh15-208ENSMUST00000125006 4863 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Pcdh15-232ENSMUST00000177420 4878 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Tor1aip2-202ENSMUST00000065648 2529 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 AC155298.3-201ENSMUST00000225307 3220 ntBASIC8.24□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 Ahi1-202ENSMUST00000163505 2067 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Wdr76-203ENSMUST00000110602 4170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm29761-201ENSMUST00000215964 1939 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 Olfr1294-202ENSMUST00000208675 1983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 Rnf219-202ENSMUST00000227640 1632 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 AC154355.1-201ENSMUST00000224604 2162 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 Gm22438-201ENSMUST00000104049 132 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Bdnf-203ENSMUST00000111043 3839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 Gm12027-201ENSMUST00000146531 949 ntTSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 1700073E17Rik-203ENSMUST00000148424 741 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm21182-201ENSMUST00000178899 794 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Mir124-2hg-201ENSMUST00000185804 3844 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm28455-201ENSMUST00000189105 1290 ntBASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Smpx-208ENSMUST00000190091 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Zfp799-203ENSMUST00000201876 632 ntTSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 Slc7a2-204ENSMUST00000118432 3681 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 Gm6117-201ENSMUST00000150540 1333 ntTSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 Csrnp3-201ENSMUST00000053910 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.23□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 4930505O20Rik-201ENSMUST00000142188 1758 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 Sgcg-201ENSMUST00000077954 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
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Hoxa13Q62424 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps78-201ENSMUST00000178185 924 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Vmn1r-ps76-201ENSMUST00000179492 924 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Rps19-ps8-201ENSMUST00000180714 422 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm10925-201ENSMUST00000189941 678 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm38384-201ENSMUST00000195413 1122 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm29755-201ENSMUST00000196976 948 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 E230029C05Rik-204ENSMUST00000208266 875 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm9652-201ENSMUST00000209345 163 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm45301-201ENSMUST00000211359 933 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Olfr738-202ENSMUST00000214320 2114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Gm8075-202ENSMUST00000223088 682 ntTSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 CT025630.2-201ENSMUST00000228293 487 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Olfr683-201ENSMUST00000061284 960 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Olfr458-201ENSMUST00000090156 942 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Pcm1-204ENSMUST00000211247 6484 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Olfr802-202ENSMUST00000203785 5535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Osbpl9-201ENSMUST00000030288 2871 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 Pfkfb3-214ENSMUST00000179584 4756 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Hoxa13Q62424 A730082K24Rik-203ENSMUST00000205913 1808 ntTSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
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