Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Slc38a2-201ENSMUST00000023099 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Rrm1-201ENSMUST00000033283 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gramd2-203ENSMUST00000128944 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm11848-201ENSMUST00000121207 973 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm12107-201ENSMUST00000132857 889 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm22312-201ENSMUST00000158005 130 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm2453-201ENSMUST00000193383 357 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm7343-201ENSMUST00000194510 1061 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 AC121788.1-201ENSMUST00000218514 1046 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Klrc2-201ENSMUST00000071920 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Akap10-201ENSMUST00000058173 2015 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Kif6-207ENSMUST00000162854 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm14418-201ENSMUST00000108955 1415 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Kdm5d-207ENSMUST00000189069 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 4930432O09Rik-201ENSMUST00000219710 1986 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Vmn2r-ps159-201ENSMUST00000074107 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Olfr212-203ENSMUST00000220134 2349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Atg4a-ps-201ENSMUST00000117271 2115 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm6249-201ENSMUST00000211142 3314 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm14496-201ENSMUST00000071760 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 C130071C03Rik-201ENSMUST00000131907 3590 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Olfr97-203ENSMUST00000213328 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Rims2-205ENSMUST00000227243 4760 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Xlr5a-203ENSMUST00000114521 1474 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm11590-201ENSMUST00000118999 1455 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Nup93-203ENSMUST00000211822 2674 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Trav19-201ENSMUST00000103674 446 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm15216-201ENSMUST00000118058 277 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 C030037D09Rik-201ENSMUST00000125967 367 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm15122-201ENSMUST00000135434 462 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm14012-201ENSMUST00000136025 677 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm11107-201ENSMUST00000165414 505 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Pah-201ENSMUST00000020241 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Nkain2-204ENSMUST00000218645 703 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Ift81-201ENSMUST00000031426 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Bpifa2-201ENSMUST00000048103 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Taf13-204ENSMUST00000143054 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Inpp5f-203ENSMUST00000118605 3220 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Tra2b-201ENSMUST00000023564 1369 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Tbc1d24-205ENSMUST00000168378 4350 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Sncaip-206ENSMUST00000178678 3724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Ralyl-203ENSMUST00000171075 1459 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm3510-201ENSMUST00000180447 1455 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Tarm1-202ENSMUST00000203020 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Zscan18-201ENSMUST00000046245 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm37170-201ENSMUST00000194488 1934 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Lmod1-201ENSMUST00000059352 3948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm20396-201ENSMUST00000173358 745 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm45407-201ENSMUST00000209499 3676 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm39463-201ENSMUST00000214575 735 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm36758-201ENSMUST00000222594 310 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Olfr449-201ENSMUST00000050729 1037 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Olfr777-201ENSMUST00000080313 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Xlr5b-201ENSMUST00000097221 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Ftx-203ENSMUST00000130063 4275 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Clec4a1-201ENSMUST00000060484 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Mns1-201ENSMUST00000034746 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Mapk10-206ENSMUST00000133069 2732 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Cacnb2-214ENSMUST00000193800 2117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Tgfb3-201ENSMUST00000003687 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Osbpl9-219ENSMUST00000194478 2903 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Rapgef4os3-201ENSMUST00000132792 3485 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Fam160a1-201ENSMUST00000094148 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 D130040H23Rik-204ENSMUST00000212549 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm8872-201ENSMUST00000197475 1341 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Smarca2-242ENSMUST00000208751 1846 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm25690-201ENSMUST00000175439 77 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 4930584F24Rik-204ENSMUST00000198070 1163 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm40645-202ENSMUST00000219828 874 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 AC154324.1-201ENSMUST00000226711 814 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 AC111010.1-203ENSMUST00000227287 1548 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Fto-204ENSMUST00000136802 3751 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 AC093043.2-201ENSMUST00000228616 2017 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
AtmQ62388 Olfr544-201ENSMUST00000051201 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.2 ms