Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Trrap-201ENSMUST00000038980 12344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb4-203ENSMUST00000102761 8039 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm44121-201ENSMUST00000205169 2006 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r6-204ENSMUST00000227188 8185 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm14546-201ENSMUST00000138275 1647 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4930448K20Rik-202ENSMUST00000182072 1433 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 2610020C07Rik-201ENSMUST00000181526 2925 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Grik2-207ENSMUST00000218823 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Pln-201ENSMUST00000046221 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 BC051142-203ENSMUST00000114175 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r71-203ENSMUST00000227003 5048 ntAPPRIS P2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Ptprc-204ENSMUST00000182755 4611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj16-201ENSMUST00000106635 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Zfp809-205ENSMUST00000215618 1313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm30948-201ENSMUST00000195683 4827 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r176-203ENSMUST00000226767 2536 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r176-205ENSMUST00000227661 2507 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r176-206ENSMUST00000228280 2532 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Cnot2-210ENSMUST00000168036 2693 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Rgn-201ENSMUST00000023832 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm11242-201ENSMUST00000120103 2457 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Trp63-208ENSMUST00000115310 5366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm23659-201ENSMUST00000102245 110 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm25607-201ENSMUST00000104020 127 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm10936-201ENSMUST00000105264 252 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm9836-201ENSMUST00000117132 216 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm5319-201ENSMUST00000118965 873 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm16523-201ENSMUST00000121253 592 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Trav8-2-201ENSMUST00000130122 337 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 F730035M05Rik-201ENSMUST00000145871 1296 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Etfbkmt-207ENSMUST00000147934 1092 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm24943-201ENSMUST00000158329 433 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm6428-201ENSMUST00000161062 345 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Spint4-201ENSMUST00000017454 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm25193-201ENSMUST00000176615 97 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm5435-201ENSMUST00000179295 1150 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm29357-201ENSMUST00000186877 698 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm37481-201ENSMUST00000195176 403 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm36667-201ENSMUST00000196125 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm31243-201ENSMUST00000197498 632 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm7442-201ENSMUST00000197778 383 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm42424-201ENSMUST00000198319 376 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps24-201ENSMUST00000199364 858 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm16273-201ENSMUST00000202238 268 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm44148-201ENSMUST00000203718 316 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm29977-201ENSMUST00000206804 724 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Nudc-ps1-201ENSMUST00000209275 551 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4930503E24Rik-202ENSMUST00000219657 942 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC163354.1-202ENSMUST00000221460 656 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 4933427E13Rik-201ENSMUST00000044347 381 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Trex1-201ENSMUST00000061973 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1126-201ENSMUST00000071355 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1129-201ENSMUST00000081034 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s97-201ENSMUST00000082585 113 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Fam49a-205ENSMUST00000223061 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Diaph2-202ENSMUST00000113320 8196 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Krt39-201ENSMUST00000076948 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Catsperg1-201ENSMUST00000047846 3566 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Krt222-202ENSMUST00000103132 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm37138-201ENSMUST00000194564 2089 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Poln-205ENSMUST00000202409 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 B020004C17Rik-201ENSMUST00000178161 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 AC162936.1-201ENSMUST00000223676 2368 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Zhx1-203ENSMUST00000175805 4839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Stat4-202ENSMUST00000168302 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm38262-201ENSMUST00000194760 1382 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Trim24-202ENSMUST00000120238 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Fam227b-202ENSMUST00000110448 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Spire1-202ENSMUST00000082243 4950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Rps15a-207ENSMUST00000172457 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm42513-201ENSMUST00000197831 2119 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 A930004J17Rik-201ENSMUST00000192689 4610 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Ikzf3-201ENSMUST00000103141 3658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Oas2-202ENSMUST00000081491 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Il18bp-201ENSMUST00000094134 1311 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm498-207ENSMUST00000207630 1483 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm13615-201ENSMUST00000120242 1612 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Pja2-201ENSMUST00000024888 4531 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vezt-204ENSMUST00000119818 11138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm10401-201ENSMUST00000100848 607 ntAPPRIS P1 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Znhit3-201ENSMUST00000103195 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Phtf1-204ENSMUST00000117150 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm12477-201ENSMUST00000121221 571 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Sft2d1Q5SSN7 Gm14010-201ENSMUST00000131961 374 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
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