Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm13735-201ENSMUST00000120217 670 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Olfr397-201ENSMUST00000121280 1091 ntAPPRIS P1 BASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Gm15362-201ENSMUST00000121459 388 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 Gm12354-201ENSMUST00000124319 554 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.87
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Usp48Q3V0C5 Gm25180-201ENSMUST00000157746 115 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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Usp48Q3V0C5 Gm17061-201ENSMUST00000163167 499 ntBASIC9.6□□□□□ -0.87
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Usp48Q3V0C5 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.87
Usp48Q3V0C5 5330416C01Rik-203ENSMUST00000144993 3287 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Usp48Q3V0C5 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms