Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Muc5ac-201ENSMUST00000041924 8256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 AC105958.1-201ENSMUST00000214783 2144 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 Xrn2-201ENSMUST00000028921 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 Sept3-201ENSMUST00000023095 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 Hmg20a-201ENSMUST00000034879 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 Tmem173-201ENSMUST00000115728 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 Mcmdc2-205ENSMUST00000171802 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm28758-201ENSMUST00000186123 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Ttc21bQ0HA38 Gm12886-201ENSMUST00000106266 1149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm11501-201ENSMUST00000118039 581 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Olfr1127-ps1-201ENSMUST00000119555 892 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Mir1953-201ENSMUST00000157866 89 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Airn-202ENSMUST00000159731 435 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Rpp14-202ENSMUST00000180369 477 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Peak1os-201ENSMUST00000181444 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Mir7082-201ENSMUST00000183526 92 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm19211-201ENSMUST00000200251 1206 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 AC121997.2-202ENSMUST00000227158 939 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Klf10-202ENSMUST00000226363 2917 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm29123-201ENSMUST00000185808 3657 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Tns1-208ENSMUST00000187584 9916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r12-201ENSMUST00000095922 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm40649-201ENSMUST00000219795 1457 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Ces1c-201ENSMUST00000034189 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Folh1-201ENSMUST00000001824 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Rel-201ENSMUST00000102864 7466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm28370-201ENSMUST00000185303 3375 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Mir674-201ENSMUST00000102421 100 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Igkv4-90-201ENSMUST00000103334 352 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Iglc2-201ENSMUST00000103749 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm16016-201ENSMUST00000120831 550 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm13708-201ENSMUST00000145170 390 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm20461-201ENSMUST00000174600 305 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 1700003P14Rik-201ENSMUST00000185602 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm28377-201ENSMUST00000189695 720 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm37439-201ENSMUST00000193150 856 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 AC117240.1-201ENSMUST00000199436 61 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Usf2-ps1-201ENSMUST00000206657 311 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 1810049I09Rik-202ENSMUST00000206760 556 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Olfr726-202ENSMUST00000206834 1256 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm31812-201ENSMUST00000210323 1170 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Olfr1440-201ENSMUST00000054567 948 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Olfr13-201ENSMUST00000059512 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Olfr1306-201ENSMUST00000099607 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Ptbp2-207ENSMUST00000197464 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Slc5a6-206ENSMUST00000202556 3078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm5157-201ENSMUST00000185914 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 1700024B05Rik-201ENSMUST00000064162 1576 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Ank3-202ENSMUST00000054167 5769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Cdc14b-202ENSMUST00000109769 2886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 1810046K07Rik-201ENSMUST00000039959 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Cep72-201ENSMUST00000036456 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Trmt5-201ENSMUST00000116420 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Tbx5-201ENSMUST00000018407 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 AC161247.1-201ENSMUST00000217744 2295 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Tmem43-201ENSMUST00000032183 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Rhoh-201ENSMUST00000031106 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm6614-202ENSMUST00000181628 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Kcne4-202ENSMUST00000187432 1813 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Mettl14-202ENSMUST00000090371 7197 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm12369-201ENSMUST00000121343 942 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ttc21bQ0HA38 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm2026-203ENSMUST00000174416 532 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Sbp-206ENSMUST00000183155 882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm44287-201ENSMUST00000203069 290 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Ndufa4-204ENSMUST00000204714 452 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm34623-201ENSMUST00000210900 977 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm29154-209ENSMUST00000213614 878 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 AC165349.1-201ENSMUST00000217896 424 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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Ttc21bQ0HA38 Olfr275-201ENSMUST00000095085 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 1700041M19Rik-205ENSMUST00000208105 1356 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm13986-202ENSMUST00000148587 3469 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Itgb3bp-204ENSMUST00000146258 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Pde7b-201ENSMUST00000020165 4137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Arhgap21-210ENSMUST00000154230 6972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 4932415M13Rik-202ENSMUST00000184645 3063 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Xpo4-201ENSMUST00000089482 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm37739-201ENSMUST00000191742 1505 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm38003-201ENSMUST00000191968 1504 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Pdilt-201ENSMUST00000033267 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Gm28515-201ENSMUST00000189823 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 CT009757.4-201ENSMUST00000221520 2541 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Calcr-202ENSMUST00000115622 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Prepl-202ENSMUST00000171795 3830 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Lhx4-201ENSMUST00000027740 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Ttc21bQ0HA38 Thada-201ENSMUST00000047524 7884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms