Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Crem-204ENSMUST00000122958 2254 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm37663-201ENSMUST00000191887 2299 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Helz2-203ENSMUST00000121484 10063 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Nsun6-204ENSMUST00000114715 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Clasp1-218ENSMUST00000190571 7910 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Olfr943-205ENSMUST00000215770 8308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Hist1h1d-201ENSMUST00000045301 7425 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm16973-202ENSMUST00000180752 1972 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Kcnd2-201ENSMUST00000081542 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm10862-201ENSMUST00000193956 3350 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Ppp1r7-201ENSMUST00000027494 10315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm11726-201ENSMUST00000121028 424 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm13221-201ENSMUST00000121712 430 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Krtap11-1-201ENSMUST00000171542 1008 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Obox4-ps31-201ENSMUST00000177210 1137 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm9999-202ENSMUST00000185832 335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm2447-201ENSMUST00000191954 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm43357-201ENSMUST00000197132 342 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm44613-201ENSMUST00000205637 877 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm44613-202ENSMUST00000205962 691 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm18559-201ENSMUST00000208249 604 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm6145-202ENSMUST00000210292 787 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Olfr1500-206ENSMUST00000217079 1025 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Erh-204ENSMUST00000218364 665 ntTSL 3 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 CT009718.2-202ENSMUST00000222092 704 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 AC131117.2-202ENSMUST00000224539 547 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 AC152394.1-201ENSMUST00000227360 1086 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 AC121542.2-201ENSMUST00000227529 400 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 3110018I06Rik-201ENSMUST00000082269 1005 ntAPPRIS P1 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Olfr435-202ENSMUST00000215565 2491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Ppp4r4-202ENSMUST00000187155 2675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm13619-201ENSMUST00000155722 2138 ntTSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm3591-201ENSMUST00000164408 1745 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Meiob-201ENSMUST00000024972 1703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Zfp386-204ENSMUST00000183125 4779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm28965-201ENSMUST00000186015 1500 ntTSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Zfp976-201ENSMUST00000098503 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Pkd1-201ENSMUST00000035565 14164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Cfap69-210ENSMUST00000196165 4408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Cd36-204ENSMUST00000170051 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Dab2-204ENSMUST00000110664 4450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 4930502E18Rik-201ENSMUST00000069209 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Vmn2r63-201ENSMUST00000163803 2580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Gm38244-201ENSMUST00000191737 2586 ntBASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Mrpl35-201ENSMUST00000065103 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Zfp239-207ENSMUST00000172088 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Olfr943-202ENSMUST00000213176 8275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Hipk2-205ENSMUST00000160962 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.13
Hoxc13P50207 Trappc13-203ENSMUST00000141557 3502 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Slc12a6-202ENSMUST00000053666 6060 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 G6pc2-202ENSMUST00000112317 1749 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm12608-201ENSMUST00000122013 1715 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Igkv12-44-201ENSMUST00000103367 401 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm8812-201ENSMUST00000118496 412 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Tm6sf1-202ENSMUST00000119543 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm22275-201ENSMUST00000122470 310 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm5834-201ENSMUST00000126680 1026 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm12600-201ENSMUST00000146704 708 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm23077-201ENSMUST00000157854 116 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm15734-201ENSMUST00000163076 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Svs6-201ENSMUST00000017144 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Mir6241-201ENSMUST00000184225 103 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm28528-201ENSMUST00000188560 857 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm37294-201ENSMUST00000193461 494 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm9419-201ENSMUST00000200672 567 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm44112-201ENSMUST00000204787 372 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm40685-201ENSMUST00000217861 580 ntTSL 3 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm32235-202ENSMUST00000220286 898 ntTSL 5 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm46424-201ENSMUST00000221567 168 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm34047-201ENSMUST00000223547 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Mir138-2-201ENSMUST00000083578 71 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm16020-201ENSMUST00000084281 210 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gpr15-201ENSMUST00000089318 1290 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Olfr1211-201ENSMUST00000099808 936 ntAPPRIS P1 BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Tmem232-201ENSMUST00000062161 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Zfp874a-201ENSMUST00000057241 2210 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Apobec3-202ENSMUST00000109620 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Gm11342-203ENSMUST00000224879 1324 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Cxcr4-201ENSMUST00000052172 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Adarb2-202ENSMUST00000123187 4002 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 AC129308.1-201ENSMUST00000223800 2309 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Atp8a1-207ENSMUST00000135930 8069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Irak3-205ENSMUST00000145665 2869 ntTSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Cphx1-204ENSMUST00000184016 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 AC091783.1-201ENSMUST00000223614 1613 ntBASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Hoxc13P50207 Zfp143-204ENSMUST00000209505 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.96□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms