Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Gm10610-203ENSMUST00000208877 1206 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm8575-201ENSMUST00000210262 521 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm45463-202ENSMUST00000210735 1188 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 AC122428.4-201ENSMUST00000213494 589 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Odf3l1-202ENSMUST00000215694 1212 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm45925-202ENSMUST00000219904 1136 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm9249-201ENSMUST00000221420 578 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 AC154849.2-201ENSMUST00000223781 974 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr765-201ENSMUST00000071559 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr1377-201ENSMUST00000075177 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm13304-201ENSMUST00000098123 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 2310058D17Rik-201ENSMUST00000131221 3201 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Ubtfl1-201ENSMUST00000098973 1649 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Frmd7-201ENSMUST00000060650 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Ctnna2-202ENSMUST00000159626 3908 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gcnt2-202ENSMUST00000069958 3929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm31408-201ENSMUST00000216695 1455 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr901-202ENSMUST00000216502 2639 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Ephb2-202ENSMUST00000105845 10902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Chm-202ENSMUST00000113388 4749 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Olfr60-202ENSMUST00000210932 2383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm38315-201ENSMUST00000194286 2437 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Gm15169-201ENSMUST00000126095 2753 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Csta1-201ENSMUST00000096090 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Ddx6-201ENSMUST00000170489 6065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Pvt1-202ENSMUST00000181416 3319 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Sh3d19-203ENSMUST00000182666 6886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
Hoxc11P31313 Mef2c-228ENSMUST00000199450 2862 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ssh2-201ENSMUST00000037912 9178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm37245-201ENSMUST00000195137 2713 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Nr5a2-201ENSMUST00000027649 4733 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm11864-201ENSMUST00000116179 1220 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Rps25-ps1-201ENSMUST00000119876 378 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm13622-201ENSMUST00000120658 433 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Sh3d2c-ps1-201ENSMUST00000121498 904 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ccdc142os-201ENSMUST00000125657 891 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Rsf1os1-201ENSMUST00000126902 324 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm15092-201ENSMUST00000138467 574 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Il1rn-205ENSMUST00000142093 321 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Btf3-205ENSMUST00000152704 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gtsf1-209ENSMUST00000153930 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Cers6-206ENSMUST00000176018 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm26832-201ENSMUST00000181456 1282 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm28221-201ENSMUST00000185617 347 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm18797-201ENSMUST00000190809 1174 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm38217-201ENSMUST00000194358 910 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm37480-201ENSMUST00000194795 550 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm43387-201ENSMUST00000196896 1066 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm42804-201ENSMUST00000199701 178 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm44196-202ENSMUST00000204186 812 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC123920.1-201ENSMUST00000221449 384 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC154747.4-201ENSMUST00000224802 903 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC154361.1-201ENSMUST00000225694 745 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr1287-201ENSMUST00000075390 918 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm42568-201ENSMUST00000195639 1841 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Mbnl1-211ENSMUST00000192807 2906 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Lhfpl2-204ENSMUST00000121618 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ndrg3-202ENSMUST00000072298 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Nat2-202ENSMUST00000163856 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm21056-201ENSMUST00000221636 4635 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Zfp790-201ENSMUST00000032796 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm10637-202ENSMUST00000184702 3233 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Ulk4-209ENSMUST00000171923 4103 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Mcm9-203ENSMUST00000219547 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Elavl4-207ENSMUST00000106603 3761 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Cspp1-217ENSMUST00000186294 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm38380-201ENSMUST00000195718 2248 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Olfr401-202ENSMUST00000213754 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm7945-201ENSMUST00000164948 1428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 CT030170.4-203ENSMUST00000221062 1403 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm26518-201ENSMUST00000181328 3270 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 AC140409.2-201ENSMUST00000216936 3079 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 St3gal6-202ENSMUST00000114358 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Saa4-201ENSMUST00000006952 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Pard3bos1-202ENSMUST00000138535 1878 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 CT025566.1-202ENSMUST00000224800 2511 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Iglv1-201ENSMUST00000103746 391 ntAPPRIS P1 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm22927-201ENSMUST00000104268 131 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm25276-201ENSMUST00000104300 124 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm11011-201ENSMUST00000109160 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm14547-201ENSMUST00000138341 371 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Hoxc11P31313 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
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