Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gm6633-201ENSMUST00000173851 270 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Vmn1r-ps26-201ENSMUST00000174239 840 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Trav9d-1-201ENSMUST00000178426 337 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm21917-203ENSMUST00000180309 561 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Snhg6-205ENSMUST00000182819 816 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm28281-201ENSMUST00000185658 187 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 1810007D17Rik-201ENSMUST00000187629 742 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm29460-201ENSMUST00000188607 714 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Ighv1-11-201ENSMUST00000191801 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm43954-201ENSMUST00000204634 544 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm7210-201ENSMUST00000209309 1067 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 1700018P08Rik-201ENSMUST00000212522 1239 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 AC155929.4-201ENSMUST00000218493 491 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 AC144783.1-201ENSMUST00000219103 960 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 AC159244.2-201ENSMUST00000222051 220 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 AC165260.2-202ENSMUST00000224998 631 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 AC154506.2-201ENSMUST00000225481 1276 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Try4-201ENSMUST00000031913 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Cutal-202ENSMUST00000047447 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Ang2-201ENSMUST00000051274 438 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Rnase11-201ENSMUST00000076106 713 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Vmn1r78-201ENSMUST00000078039 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm5560-201ENSMUST00000086918 892 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Psme1-201ENSMUST00000089619 711 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Acsl1-203ENSMUST00000110372 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gabra1-205ENSMUST00000205546 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm19337-201ENSMUST00000218100 1584 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Tdgf1-201ENSMUST00000035075 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 D7Ertd443e-201ENSMUST00000094002 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 2310001H17Rik-202ENSMUST00000181238 2237 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Dlgap2-201ENSMUST00000043279 3580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 4930509J09Rik-201ENSMUST00000194514 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm42721-201ENSMUST00000197165 1523 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Tgm3-201ENSMUST00000110299 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Tbc1d15-201ENSMUST00000020339 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm4907-201ENSMUST00000116614 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 CT009515.4-201ENSMUST00000228165 1494 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Srcap-206ENSMUST00000186954 9345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Mtmr4-203ENSMUST00000119628 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Ggta1-204ENSMUST00000113001 3340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 D430042O09Rik-201ENSMUST00000069660 6148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm5442-201ENSMUST00000202121 2034 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Smok2b-202ENSMUST00000162940 2306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 1110008L16Rik-205ENSMUST00000184766 2250 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm37109-201ENSMUST00000195475 2254 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Sec16b-202ENSMUST00000086130 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Atg4a-201ENSMUST00000112971 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm38366-201ENSMUST00000193127 1934 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 4930510E17Rik-201ENSMUST00000034550 1639 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm11639-201ENSMUST00000148007 3613 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm43154-206ENSMUST00000209562 1884 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Olfr1393-202ENSMUST00000213323 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Cabyr-202ENSMUST00000115857 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Spata17-205ENSMUST00000183819 1552 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Zfp592-201ENSMUST00000107353 7297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Defb20-201ENSMUST00000109836 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm9126-201ENSMUST00000117072 416 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Xlr5d-ps-201ENSMUST00000117501 782 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm13454-201ENSMUST00000118166 483 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm12433-201ENSMUST00000119659 255 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm15166-201ENSMUST00000120790 385 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm13000-201ENSMUST00000120937 496 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm11933-201ENSMUST00000121550 375 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm5394-201ENSMUST00000121935 975 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Myhas-201ENSMUST00000137662 787 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm11335-201ENSMUST00000148743 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm26159-201ENSMUST00000158968 104 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Coq8a-208ENSMUST00000160879 561 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Psd3-211ENSMUST00000178529 828 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm5300-201ENSMUST00000182201 1003 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm29545-201ENSMUST00000188878 694 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Ly6a-205ENSMUST00000189068 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm29138-201ENSMUST00000191444 348 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 1700006P03Rik-201ENSMUST00000191810 409 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm6639-201ENSMUST00000196349 429 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 AI506816-201ENSMUST00000197153 474 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm5043-201ENSMUST00000202103 820 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm43957-201ENSMUST00000203606 362 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm44722-201ENSMUST00000206473 436 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Olfr848-ps1-201ENSMUST00000212241 930 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 AC091260.1-201ENSMUST00000216112 229 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 AC157017.1-201ENSMUST00000220148 364 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 AC154323.2-201ENSMUST00000226557 1151 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Tyrobp-201ENSMUST00000032800 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Mir195a-201ENSMUST00000083477 94 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Lcn11-201ENSMUST00000091278 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Olfr1290-201ENSMUST00000099616 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Nt5c1b-211ENSMUST00000218339 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Nt5c1b-201ENSMUST00000002456 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Bcorl1-201ENSMUST00000037596 7360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm15834-201ENSMUST00000129740 2097 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Zfp758-204ENSMUST00000149699 2876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Gm14273-201ENSMUST00000136315 1786 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
ChgaP26339 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms