Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Gm5407-201ENSMUST00000080694 747 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm7275-201ENSMUST00000088296 744 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Grxcr1-201ENSMUST00000094715 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Klrb1c-201ENSMUST00000167691 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Pglyrp4-203ENSMUST00000169698 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gramd1c-204ENSMUST00000214098 2046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Trim43c-202ENSMUST00000186363 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm26544-201ENSMUST00000181404 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 AI182371-207ENSMUST00000226972 1642 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Zfp663-202ENSMUST00000103085 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Olfr1226-205ENSMUST00000216445 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Ect2-202ENSMUST00000108298 4024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm9938-201ENSMUST00000067077 1756 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Cyp2j13-201ENSMUST00000030305 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm43360-201ENSMUST00000197656 2887 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 D3Ertd751e-207ENSMUST00000146165 3574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm20531-201ENSMUST00000174861 1373 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
Vpreb1P13372 Gm43429-201ENSMUST00000197889 2251 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Mmp10-201ENSMUST00000034488 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Fmn1-202ENSMUST00000099576 11817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Tm4sf20-201ENSMUST00000027331 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Tdrd7-202ENSMUST00000107777 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm11961-201ENSMUST00000135775 1319 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm15182-201ENSMUST00000120832 1676 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Chil6-201ENSMUST00000029510 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr904-202ENSMUST00000216724 5197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr1381-202ENSMUST00000213256 4954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Dlgap5-208ENSMUST00000180299 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Tssk1-201ENSMUST00000046937 3700 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 4921534H16Rik-202ENSMUST00000162911 2838 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm38081-201ENSMUST00000192680 1645 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Palmd-202ENSMUST00000119557 3305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm25501-201ENSMUST00000104429 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Aph1b-202ENSMUST00000113730 682 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Fate1-202ENSMUST00000114569 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm12460-201ENSMUST00000117147 357 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm13526-201ENSMUST00000117970 189 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm11245-201ENSMUST00000119419 1037 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm15220-201ENSMUST00000120730 379 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr268-ps1-201ENSMUST00000121395 945 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm16267-201ENSMUST00000140569 732 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Vmn1r190-ps-201ENSMUST00000155950 903 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Oas1h-202ENSMUST00000171820 931 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm20765-201ENSMUST00000177792 795 ntAPPRIS P2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm21312-201ENSMUST00000179258 795 ntAPPRIS P2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm3142-201ENSMUST00000190107 414 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm38087-201ENSMUST00000193653 265 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm6394-201ENSMUST00000197077 477 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 1700113A16Rik-202ENSMUST00000197172 776 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm32585-201ENSMUST00000198586 764 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm43837-201ENSMUST00000200306 668 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm44694-201ENSMUST00000205317 1298 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm42402-201ENSMUST00000208341 1054 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 4930579P08Rik-201ENSMUST00000218193 1227 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC122539.2-201ENSMUST00000220207 404 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC156576.3-201ENSMUST00000221940 452 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC165155.1-201ENSMUST00000228932 445 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Plac8-201ENSMUST00000031264 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr419-201ENSMUST00000061990 1088 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Fate1-201ENSMUST00000066116 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Mir412-201ENSMUST00000083636 80 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr1231-201ENSMUST00000099786 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 4833423E24Rik-201ENSMUST00000099923 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr959-203ENSMUST00000216298 5616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Mme-201ENSMUST00000029400 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Wnk1-218ENSMUST00000161512 1426 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC122426.2-201ENSMUST00000216522 2947 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Olfr1199-203ENSMUST00000131038 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Mstn-201ENSMUST00000027269 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Osbpl9-216ENSMUST00000161363 2356 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm37906-201ENSMUST00000192050 3035 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Nxpe4-201ENSMUST00000093853 3173 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm10825-201ENSMUST00000180537 4478 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Klhl23-201ENSMUST00000053087 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm20489-201ENSMUST00000117736 1350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm28867-201ENSMUST00000190194 2166 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AL607131.1-201ENSMUST00000222575 1835 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Mfap3-201ENSMUST00000020830 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Gm43864-201ENSMUST00000204452 4028 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Uevld-201ENSMUST00000094398 4616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 Tdrkh-204ENSMUST00000196606 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Vpreb1P13372 AC112680.1-201ENSMUST00000215435 1349 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms