Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm12930-201ENSMUST00000146679 676 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm23317-201ENSMUST00000157999 129 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm24004-201ENSMUST00000158460 178 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm17258-201ENSMUST00000168462 1266 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm17157-201ENSMUST00000172397 348 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm5977-201ENSMUST00000174304 573 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Vmn2r-ps31-201ENSMUST00000176474 760 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Trav5d-4-201ENSMUST00000179701 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Trav5n-4-201ENSMUST00000179997 343 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm19705-204ENSMUST00000181524 413 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 D7Ertd128e-201ENSMUST00000189744 928 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm5857-201ENSMUST00000198953 493 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm43690-201ENSMUST00000201213 266 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm44725-201ENSMUST00000205307 391 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm19201-201ENSMUST00000210127 778 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm46124-201ENSMUST00000215223 808 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 AC158239.1-201ENSMUST00000216890 779 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Olfr1139-ps1-201ENSMUST00000217634 168 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 AC122301.3-201ENSMUST00000217707 716 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 CT010462.1-201ENSMUST00000220554 1200 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 AC124709.1-201ENSMUST00000227296 620 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Aamdc-201ENSMUST00000042627 627 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Pglyrp4-201ENSMUST00000047745 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Olfr167-201ENSMUST00000054606 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Vmn1r219-201ENSMUST00000076180 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Mrgprb4-201ENSMUST00000094388 1219 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm15509-201ENSMUST00000162615 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Rad51b-203ENSMUST00000218039 2187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gtdc1-201ENSMUST00000049051 2197 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Kcnj15-204ENSMUST00000113856 5129 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Zfp607b-201ENSMUST00000076421 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm3203-201ENSMUST00000197670 2389 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Kdm4c-201ENSMUST00000030102 4196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Pan2-203ENSMUST00000218315 4379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Ntsr1-201ENSMUST00000029084 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Vmn2r92-201ENSMUST00000169686 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Harbi1-205ENSMUST00000142692 3686 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm17027-201ENSMUST00000171202 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Cts3-201ENSMUST00000054702 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gbp9-202ENSMUST00000100961 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Olfr994-202ENSMUST00000214679 1648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Mrps17-203ENSMUST00000119576 5061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Etl4-204ENSMUST00000114606 5284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Celf1-207ENSMUST00000111452 7800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Luzp4-201ENSMUST00000101185 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm37210-201ENSMUST00000192484 2004 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Gm44652-201ENSMUST00000208648 2854 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Zbtb18-206ENSMUST00000193480 3734 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
P10404 Ehbp1-207ENSMUST00000180360 4971 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Dpep2-202ENSMUST00000117555 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Prr13-205ENSMUST00000171245 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm42981-201ENSMUST00000200184 3252 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Serpinb8-201ENSMUST00000000514 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Mdc1-201ENSMUST00000082337 7335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Iars-206ENSMUST00000165316 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Pde10a-204ENSMUST00000115715 2783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm35439-201ENSMUST00000200051 4809 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Htt-201ENSMUST00000080036 13215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Klhl5-205ENSMUST00000204348 3380 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Zfp930-201ENSMUST00000110216 1323 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Lrrfip2-206ENSMUST00000197241 1500 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Dctn5-201ENSMUST00000033156 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 A530064D06Rik-202ENSMUST00000053612 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Sema6a-206ENSMUST00000135790 4339 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Cep97-201ENSMUST00000023270 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Usp15-201ENSMUST00000020334 4666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Ttc29-201ENSMUST00000049395 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 CR974429.2-201ENSMUST00000221883 1696 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 4930562C15Rik-201ENSMUST00000100211 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Igkv12-41-201ENSMUST00000103369 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm13682-201ENSMUST00000117524 702 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm5406-201ENSMUST00000120054 766 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm14989-201ENSMUST00000120497 207 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm13872-203ENSMUST00000147082 657 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm43518-201ENSMUST00000166129 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Vmn1r113-202ENSMUST00000173723 924 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Vmn2r-ps85-201ENSMUST00000174022 940 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Vmn1r-ps27-201ENSMUST00000174619 985 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm7481-201ENSMUST00000182020 995 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm5350-201ENSMUST00000182057 1002 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm27159-201ENSMUST00000185132 432 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Scgb1b6-ps-201ENSMUST00000185337 199 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm29561-201ENSMUST00000187838 631 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm37950-201ENSMUST00000191616 364 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm32569-201ENSMUST00000193955 604 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Gm43461-201ENSMUST00000202351 996 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Speer9-ps1-201ENSMUST00000203447 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 5930435M05Rik-202ENSMUST00000207936 414 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
P10404 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms