Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Reg1-203ENSMUST00000204687 904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm5314-201ENSMUST00000204852 466 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm44577-201ENSMUST00000207413 1284 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm7394-201ENSMUST00000209138 1032 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm45391-201ENSMUST00000211563 576 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm7943-201ENSMUST00000212078 1034 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm8804-201ENSMUST00000212292 798 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 CT025685.1-201ENSMUST00000213716 150 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC166078.1-201ENSMUST00000217211 584 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm2089-201ENSMUST00000218294 479 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC166361.1-201ENSMUST00000218567 403 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 CT030260.1-201ENSMUST00000223243 442 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC132590.1-201ENSMUST00000224374 1164 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC165154.2-201ENSMUST00000227310 336 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Myl12a-201ENSMUST00000024846 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Prl7a2-201ENSMUST00000006660 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm37278-201ENSMUST00000191619 2872 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm43398-201ENSMUST00000196584 2742 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr740-202ENSMUST00000214792 4103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm42514-201ENSMUST00000196636 1832 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm26873-201ENSMUST00000181390 2368 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ksr2-202ENSMUST00000180430 13125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Garnl3-201ENSMUST00000049618 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Arhgef3-202ENSMUST00000224981 3618 ntAPPRIS P1 BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Kank4os-201ENSMUST00000133455 2251 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Zfp207-202ENSMUST00000053740 1562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Cd36-203ENSMUST00000169095 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Patj-203ENSMUST00000102792 3755 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 4921504E06Rik-201ENSMUST00000062060 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Rnf146-205ENSMUST00000162335 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 D030045P18Rik-203ENSMUST00000214947 1938 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Dnajc18-201ENSMUST00000025208 5169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm6350-201ENSMUST00000195099 1339 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Selp-205ENSMUST00000162746 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm45807-201ENSMUST00000209142 2874 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Btnl10-202ENSMUST00000069941 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gcsam-201ENSMUST00000023339 3315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm25083-201ENSMUST00000102319 92 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 4930578G10Rik-202ENSMUST00000107984 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm11928-201ENSMUST00000119323 437 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm14465-201ENSMUST00000120603 567 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm24139-201ENSMUST00000122780 288 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm12665-201ENSMUST00000126063 541 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm9697-201ENSMUST00000147052 997 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm24782-201ENSMUST00000157641 132 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm22262-201ENSMUST00000158713 86 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr759-ps1-201ENSMUST00000174238 700 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm27238-201ENSMUST00000185180 417 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm8004-201ENSMUST00000187782 617 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 4930425L21Rik-202ENSMUST00000205073 871 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm18943-201ENSMUST00000207357 1216 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm45446-201ENSMUST00000209348 216 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC120002.1-201ENSMUST00000218456 331 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 4930466K18Rik-201ENSMUST00000219458 906 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 RMST_1.1-213ENSMUST00000220288 792 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr448-201ENSMUST00000058668 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Spic-201ENSMUST00000004473 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Fgf10-201ENSMUST00000022246 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Rasgrf1-202ENSMUST00000034912 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ttc9c-202ENSMUST00000096751 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 9330199G10Rik-201ENSMUST00000221601 2072 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Sema6a-210ENSMUST00000156422 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Cd44-205ENSMUST00000111191 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Amer1-201ENSMUST00000084535 8496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Dnah17-204ENSMUST00000132685 13612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gadl1-201ENSMUST00000069651 3652 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ptprg-202ENSMUST00000119888 2787 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Slu7-201ENSMUST00000020681 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Tmem167-203ENSMUST00000161568 8689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 4930524O08Rik-201ENSMUST00000183387 1451 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm6101-201ENSMUST00000195384 1867 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Olfr115-203ENSMUST00000223366 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm45360-201ENSMUST00000210698 1405 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Slc4a10-202ENSMUST00000102735 5482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Ndrg3-201ENSMUST00000069600 2612 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 A630072L19Rik-201ENSMUST00000180617 3405 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Brox-201ENSMUST00000057062 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Nt5c1b-220ENSMUST00000223534 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 2810414N06Rik-201ENSMUST00000186444 1381 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 BC028471-203ENSMUST00000202022 4113 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 AC164437.5-201ENSMUST00000227235 4414 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 P2ry14-201ENSMUST00000065220 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Stmn1-203ENSMUST00000105868 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Borcs8-202ENSMUST00000110139 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm5752-201ENSMUST00000117771 594 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm11926-201ENSMUST00000118520 430 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm11895-201ENSMUST00000122165 467 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 Gm14110-201ENSMUST00000127688 758 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
Rrn3B2RS91 1700001G01Rik-204ENSMUST00000153022 928 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms