Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Gstm5-201ENSMUST00000004134 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 1700028K03Rik-201ENSMUST00000058921 797 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 E030024N20Rik-201ENSMUST00000075293 494 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr898-201ENSMUST00000076504 951 ntAPPRIS P2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r37-201ENSMUST00000077482 909 ntAPPRIS P2 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr1504-201ENSMUST00000078282 1085 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Tcl1b2-201ENSMUST00000081379 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr149-201ENSMUST00000082027 1030 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm24871-201ENSMUST00000083099 116 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Cst7-201ENSMUST00000089200 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r188-201ENSMUST00000091739 927 ntAPPRIS P1 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rnu5g-201ENSMUST00000093721 116 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Fbxl5-203ENSMUST00000114047 2762 ntTSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm42613-201ENSMUST00000199975 1931 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Aldh18a1-207ENSMUST00000176939 3427 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm18451-201ENSMUST00000196759 1719 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Lipc-204ENSMUST00000216798 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC154257.1-201ENSMUST00000224811 1525 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Glce-201ENSMUST00000034785 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC166574.1-201ENSMUST00000226916 1309 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Focad-208ENSMUST00000159342 5456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 AC132467.1-201ENSMUST00000226498 1845 ntBASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Serpina1c-201ENSMUST00000074051 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Olfr1426-204ENSMUST00000219005 2507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Il10ra-201ENSMUST00000034594 3498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Stx8-202ENSMUST00000021286 1638 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Zbtb14-202ENSMUST00000112674 3743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm18594-201ENSMUST00000175733 1403 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Pnisr-201ENSMUST00000029911 4545 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Lrrc1-201ENSMUST00000113421 2630 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Rassf6-206ENSMUST00000202784 1919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Slmapos2-201ENSMUST00000160089 2194 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm7134-201ENSMUST00000122296 2406 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Senp1-201ENSMUST00000044189 6575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Lingo2-201ENSMUST00000065173 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Mllt3-202ENSMUST00000126353 1956 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm11872-201ENSMUST00000141819 2219 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Galnt5-201ENSMUST00000112616 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.09
Rabgef1Q9JM13 Gm16487-201ENSMUST00000105048 4037 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r44-208ENSMUST00000227456 2031 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Arhgdib-203ENSMUST00000111892 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm8858-201ENSMUST00000118259 342 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm14356-201ENSMUST00000118322 869 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm14950-201ENSMUST00000149500 1155 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm11468-201ENSMUST00000152987 383 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm12496-201ENSMUST00000154377 668 ntTSL 3 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm24241-201ENSMUST00000157787 145 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm16226-203ENSMUST00000161197 395 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm15756-201ENSMUST00000161447 670 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Mup8-202ENSMUST00000163931 986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Dcpp2-202ENSMUST00000168272 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm3275-201ENSMUST00000169145 487 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Vmn1r-ps48-201ENSMUST00000176352 886 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Mir5625-201ENSMUST00000176598 80 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Astx6-201ENSMUST00000180281 1150 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm7132-201ENSMUST00000182302 984 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm27043-201ENSMUST00000182807 958 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm8870-201ENSMUST00000188170 775 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm32051-201ENSMUST00000196818 709 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm43245-201ENSMUST00000197603 468 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm43797-201ENSMUST00000198221 532 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm43394-201ENSMUST00000198671 694 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Sycp3-201ENSMUST00000020252 1139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm42903-201ENSMUST00000202607 481 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm31522-201ENSMUST00000207942 762 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm6329-201ENSMUST00000209210 936 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm8838-201ENSMUST00000212978 541 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC162176.1-201ENSMUST00000216490 618 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm4739-201ENSMUST00000218296 633 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC160930.2-201ENSMUST00000226608 303 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Ccdc150-201ENSMUST00000027128 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Cenpx-202ENSMUST00000055424 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr1255-201ENSMUST00000057369 933 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Olfr193-201ENSMUST00000076262 1009 ntAPPRIS P1 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm10490-201ENSMUST00000086274 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 2700062C07Rik-201ENSMUST00000097646 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC113304.1-201ENSMUST00000214014 1833 ntTSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 AC131743.4-201ENSMUST00000221638 1553 ntBASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 4930533K18Rik-203ENSMUST00000219192 1307 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Mpdz-203ENSMUST00000107262 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Zfp770-201ENSMUST00000050668 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm3892-202ENSMUST00000178043 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm10593-201ENSMUST00000178906 3539 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Pcdh19-203ENSMUST00000167944 8407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Mpdz-216ENSMUST00000220807 6295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Gm12253-201ENSMUST00000108825 1356 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Ablim1-201ENSMUST00000079360 7152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Nin-202ENSMUST00000085314 9675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Oog4-201ENSMUST00000061277 1981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.1
Rabgef1Q9JM13 Specc1-203ENSMUST00000108709 6843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
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