Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Gm6356-201ENSMUST00000166618 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Uspl1-203ENSMUST00000117878 2931 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Alg11-202ENSMUST00000110737 4833 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Lifr-207ENSMUST00000227727 2489 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Cyp4a14-201ENSMUST00000030487 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm26730-201ENSMUST00000181270 1338 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Apobec3-209ENSMUST00000176325 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Zmat4-206ENSMUST00000207301 4207 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Olfr1019-201ENSMUST00000102634 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Atp5h-203ENSMUST00000106537 682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm13282-201ENSMUST00000121577 545 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm12754-201ENSMUST00000121908 454 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm22795-201ENSMUST00000157233 118 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm23497-201ENSMUST00000157738 130 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm9141-201ENSMUST00000159355 1007 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Ifrd1-204ENSMUST00000165027 1293 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm24576-201ENSMUST00000175508 248 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Magea2-203ENSMUST00000178950 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 4833412C05Rik-201ENSMUST00000181235 1083 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm9149-201ENSMUST00000182724 1007 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 0610031O16Rik-204ENSMUST00000185122 825 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 1700030F04Rik-202ENSMUST00000188781 617 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm29195-201ENSMUST00000189038 379 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm37295-201ENSMUST00000192186 109 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm37556-201ENSMUST00000193877 468 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm7565-201ENSMUST00000203611 623 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm44192-201ENSMUST00000204195 556 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm18562-201ENSMUST00000209949 915 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Rtp4-204ENSMUST00000211349 842 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm45506-201ENSMUST00000211620 280 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Olfr735-201ENSMUST00000049729 1065 ntAPPRIS P2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Wdr66-201ENSMUST00000069311 978 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Olfr1510-201ENSMUST00000079459 1014 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 B830042I05Rik-201ENSMUST00000208333 1620 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm9573-201ENSMUST00000164502 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Vmn1r35-203ENSMUST00000227354 2319 ntAPPRIS P1 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Tlr1-202ENSMUST00000197315 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Agbl1-202ENSMUST00000107442 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Amy2b-201ENSMUST00000120184 1577 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Syn3-202ENSMUST00000121789 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm38009-201ENSMUST00000194884 3341 ntBASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Olfr675-202ENSMUST00000210113 3671 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Fbxw21-203ENSMUST00000198076 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Wdr64-203ENSMUST00000194087 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Olfr462-203ENSMUST00000213928 5598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Slc24a2-202ENSMUST00000107155 2171 ntTSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Nif3l1-201ENSMUST00000087521 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Cd44-201ENSMUST00000005218 5614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Olfr1441-202ENSMUST00000214153 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.85□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm37234-201ENSMUST00000193259 1441 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Kcnj16-202ENSMUST00000106636 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Map2-205ENSMUST00000114015 5440 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Klf8-202ENSMUST00000112574 4752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Clec7a-204ENSMUST00000195589 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Sfmbt2-201ENSMUST00000041105 7874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Myot-201ENSMUST00000025349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Csnk1g1-204ENSMUST00000130798 1648 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Kif4-ps-201ENSMUST00000184686 3665 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 AC156163.1-201ENSMUST00000215598 3369 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Serpinb9-201ENSMUST00000006391 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm45753-201ENSMUST00000116473 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Sh3d19-201ENSMUST00000107664 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Trav13n-4-201ENSMUST00000103634 267 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Lair1-204ENSMUST00000108600 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Rhox3c-201ENSMUST00000115188 1053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm12920-201ENSMUST00000121818 1186 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm12088-201ENSMUST00000137364 520 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm13421-202ENSMUST00000142511 803 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm16034-201ENSMUST00000156446 480 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm22687-201ENSMUST00000158301 105 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm17660-201ENSMUST00000164471 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Cldn20-201ENSMUST00000168560 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm8304-201ENSMUST00000185744 584 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm8524-201ENSMUST00000186232 379 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm18033-201ENSMUST00000186678 550 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm29348-201ENSMUST00000189555 779 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm28164-201ENSMUST00000190143 442 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 1700025K24Rik-201ENSMUST00000190635 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm37392-201ENSMUST00000192098 516 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Scp2-ps1-201ENSMUST00000193152 499 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm6236-201ENSMUST00000193785 1009 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm42431-201ENSMUST00000196880 323 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm42752-201ENSMUST00000198394 1106 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Spam1-203ENSMUST00000202569 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Olfr1294-201ENSMUST00000208334 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm32052-201ENSMUST00000212073 799 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm4780-201ENSMUST00000213206 1242 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Gm34263-201ENSMUST00000214010 352 ntTSL 3 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Tgm4-206ENSMUST00000215247 951 ntTSL 2 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 Rpl32l-201ENSMUST00000216127 399 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC6.84□□□□□ -1.31
Use1Q9CQ56 CT572999.1-201ENSMUST00000220315 1260 ntBASIC6.84□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms