Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C7

Farsa, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, mousemouse

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FarsaQ8C0C7 Gm10552-202ENSMUST00000161763 717 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FarsaQ8C0C7 Pea15b-201ENSMUST00000182806 387 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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FarsaQ8C0C7 Gm28512-201ENSMUST00000187415 762 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FarsaQ8C0C7 Gm30239-201ENSMUST00000220776 780 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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FarsaQ8C0C7 Cdk5rap2-206ENSMUST00000144099 11847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FarsaQ8C0C7 Sgms2-201ENSMUST00000090246 5801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
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FarsaQ8C0C7 Sp1-201ENSMUST00000001326 7754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FarsaQ8C0C7 Mpdz-202ENSMUST00000107258 7241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FarsaQ8C0C7 Scd3-201ENSMUST00000026220 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FarsaQ8C0C7 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
FarsaQ8C0C7 Grik1-209ENSMUST00000227986 2942 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
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