Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Tex26-205ENSMUST00000201683 1456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Ugt1a6b-201ENSMUST00000113137 2249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm36933-201ENSMUST00000194945 3071 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Igkv4-51-201ENSMUST00000103345 394 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Homer1-210ENSMUST00000109497 779 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm14053-201ENSMUST00000121662 470 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 BC002163-201ENSMUST00000121906 319 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Cbx5-203ENSMUST00000122182 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm22342-201ENSMUST00000122647 298 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm24883-201ENSMUST00000158391 281 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm38337-201ENSMUST00000193986 599 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 A930028O11Rik-201ENSMUST00000197219 1108 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 9230114K14Rik-204ENSMUST00000199805 695 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 D130017N08Rik-204ENSMUST00000199836 506 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm44566-201ENSMUST00000207638 304 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm16475-202ENSMUST00000209033 528 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm45609-206ENSMUST00000210176 1023 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Pvrig-201ENSMUST00000211088 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 CT030709.2-201ENSMUST00000215521 399 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 AC124778.1-201ENSMUST00000216013 162 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 AC159205.2-201ENSMUST00000223759 816 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 AC154806.1-202ENSMUST00000227949 885 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Klrk1-202ENSMUST00000095412 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Pcdh15-215ENSMUST00000131321 6926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm37161-201ENSMUST00000191994 2697 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm8276-201ENSMUST00000192231 1812 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 A830010M20Rik-204ENSMUST00000112671 6756 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Trdc-201ENSMUST00000196323 3865 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Pecam1-207ENSMUST00000183610 3006 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Ap1g1-201ENSMUST00000034171 3692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Aph1c-202ENSMUST00000169282 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Mug-ps1-202ENSMUST00000189975 3293 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Sec24c-202ENSMUST00000223751 4196 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Add3-203ENSMUST00000111741 4520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 CT009604.1-201ENSMUST00000223900 1328 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Tmem175-201ENSMUST00000063272 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Olfr457-202ENSMUST00000203396 4404 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm17491-201ENSMUST00000180411 2311 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Vmn1r218-202ENSMUST00000226692 10430 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Zfp2-201ENSMUST00000109128 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm43395-201ENSMUST00000198717 2240 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm4952-201ENSMUST00000092931 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gbp3-202ENSMUST00000106221 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Slu7-206ENSMUST00000178622 3566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Atp1a4-201ENSMUST00000111243 3470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Ampd3-201ENSMUST00000005829 4094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm30698-201ENSMUST00000214789 3198 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm12346-201ENSMUST00000121455 2255 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm43728-201ENSMUST00000198817 2622 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Vwa3a-205ENSMUST00000167213 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Dnah10-201ENSMUST00000058440 14038 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Sprr2a3-202ENSMUST00000193337 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gpbp1l1-201ENSMUST00000030460 3588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Fmn1-209ENSMUST00000161731 4262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Phc3-204ENSMUST00000108255 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 4931428L18Rik-201ENSMUST00000127775 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Erich2os-201ENSMUST00000150702 608 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Ube2v1-207ENSMUST00000151365 924 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm17149-201ENSMUST00000164712 375 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Olfr819-201ENSMUST00000167974 963 ntAPPRIS P2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm19840-201ENSMUST00000169624 882 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Olfr247-201ENSMUST00000170920 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm25947-201ENSMUST00000180343 110 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Mir6922-201ENSMUST00000185099 66 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 1700066B17Rik-202ENSMUST00000187091 675 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm31406-201ENSMUST00000192297 671 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm37322-201ENSMUST00000193409 337 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm37225-201ENSMUST00000193423 325 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm43725-201ENSMUST00000200122 369 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm43694-201ENSMUST00000200773 1119 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm43904-201ENSMUST00000204945 379 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Mypopos-203ENSMUST00000206304 441 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm30790-202ENSMUST00000208527 809 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm5948-201ENSMUST00000219627 839 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm21731-202ENSMUST00000223770 886 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Ifitm5-201ENSMUST00000026562 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Morn5-201ENSMUST00000028256 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Krtap8-1-201ENSMUST00000072280 579 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm6807-201ENSMUST00000077435 888 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm10310-201ENSMUST00000095239 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Cyp2j7-201ENSMUST00000162514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 1700007E05Rik-201ENSMUST00000186196 1513 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Cep112it-201ENSMUST00000143781 4813 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Vmn1r218-204ENSMUST00000227160 9558 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Vmn1r51-213ENSMUST00000228880 4353 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Chn1os3-201ENSMUST00000147420 2707 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Yy2-201ENSMUST00000065806 2867 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Olfr1264-202ENSMUST00000216616 4311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 AC154522.1-201ENSMUST00000224647 1903 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Lyz2-201ENSMUST00000092163 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Gm44916-201ENSMUST00000208664 2194 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Dctn4-204ENSMUST00000223984 2948 ntAPPRIS ALT1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
Zfp398Q8BV16 Arnt-205ENSMUST00000107161 4260 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms