Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Katnb1-201ENSMUST00000034239 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm13749-201ENSMUST00000133244 1432 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Chil3-201ENSMUST00000063062 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Polr2a-201ENSMUST00000058470 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Vgll1-201ENSMUST00000033465 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Fam193a-201ENSMUST00000094867 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Nup133-201ENSMUST00000044795 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm22374-201ENSMUST00000104583 132 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm9112-201ENSMUST00000113610 420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm22953-201ENSMUST00000116724 101 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 2210411M09Rik-201ENSMUST00000128545 643 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm9367-201ENSMUST00000205703 546 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm44565-201ENSMUST00000208194 269 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 AC131029.2-201ENSMUST00000226696 628 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Defb15-201ENSMUST00000062586 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gcm2-201ENSMUST00000021791 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Ccdc83-203ENSMUST00000107221 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm15789-201ENSMUST00000118992 1359 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Cct8-203ENSMUST00000175977 1470 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Ldah-202ENSMUST00000169104 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Tmem33-202ENSMUST00000160352 5322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gdpgp1-201ENSMUST00000062915 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm43323-201ENSMUST00000202328 4258 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Isy1-201ENSMUST00000089497 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gsdmc-202ENSMUST00000173503 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Dbhos-201ENSMUST00000150024 4020 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Cntn5-201ENSMUST00000074133 3297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Frmd4a-219ENSMUST00000177457 6538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Hormad2-203ENSMUST00000109949 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 AC133207.1-201ENSMUST00000218960 1431 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Piwil4-203ENSMUST00000115644 3304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Hdac4-201ENSMUST00000008995 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Drp2-203ENSMUST00000113226 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Tlr11-201ENSMUST00000063570 2993 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Ccser1-201ENSMUST00000045522 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Tmc3-201ENSMUST00000039317 6221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm15114-201ENSMUST00000112788 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm33280-201ENSMUST00000193983 4340 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm22990-201ENSMUST00000175427 89 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Mir6911-201ENSMUST00000184241 69 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm37336-201ENSMUST00000192794 760 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm19035-202ENSMUST00000194575 959 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm29784-201ENSMUST00000196217 406 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm44943-201ENSMUST00000207254 300 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 AL929555.1-201ENSMUST00000215283 509 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm3678-201ENSMUST00000218888 492 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 AC154642.1-201ENSMUST00000224173 740 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Olfr930-201ENSMUST00000058789 1101 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Mir425-201ENSMUST00000083645 85 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Sptan1-205ENSMUST00000113719 8018 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Vtcn1-201ENSMUST00000054791 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm15448-205ENSMUST00000189095 1905 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Arhgap1-203ENSMUST00000111330 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Olfr62-202ENSMUST00000213189 2570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Olfr766-ps1-201ENSMUST00000204515 2909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Olfr63-203ENSMUST00000217023 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Kel-201ENSMUST00000031899 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Zscan26-201ENSMUST00000032820 3918 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm43292-201ENSMUST00000199580 2449 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Zfp426-210ENSMUST00000167457 4262 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Usp54Q8BL06 Gm9268-202ENSMUST00000173815 2565 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Rnase6-202ENSMUST00000226194 2452 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 n-R5s178-201ENSMUST00000104249 114 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm9506-201ENSMUST00000118516 320 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm15407-201ENSMUST00000136919 634 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 1700104B16Rik-202ENSMUST00000187948 722 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm8190-201ENSMUST00000199603 586 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm42673-201ENSMUST00000202676 337 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 AL591207.2-201ENSMUST00000222991 337 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Akap1-202ENSMUST00000107903 3721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 1500004A13Rik-202ENSMUST00000183707 6054 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm20236-201ENSMUST00000193037 4540 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm37094-201ENSMUST00000193352 4540 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 4933431K23Rik-204ENSMUST00000209273 2857 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Slfn10-ps-202ENSMUST00000152760 2673 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Olfr1285-202ENSMUST00000220153 1430 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Fam216b-201ENSMUST00000066437 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Ptprb-201ENSMUST00000092167 11911 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 AC158605.4-201ENSMUST00000219013 3361 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm19024-201ENSMUST00000194681 1319 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm44763-201ENSMUST00000208287 2019 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm16536-201ENSMUST00000162209 1589 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Gm37496-201ENSMUST00000191930 2509 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Pkd1l2-202ENSMUST00000109093 7389 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 6720489N17Rik-203ENSMUST00000223338 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Prkd3-208ENSMUST00000168887 5884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Sap130-201ENSMUST00000025109 4015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Usp54Q8BL06 Elmo2-205ENSMUST00000103091 4695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
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